结论：旷离扣1000工资是否合法，不能一概而论，需结合具体情况及公司规章制度来判断。

分析说明：

1. 公司规章制度：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，公司有权制定规章制度来管理员工，包括考勤、奖惩等方面。但这些规章制度必须合法、合理，且经过民主程序制定，并向员工公示或告知。
   • 如果公司的规章制度中明确规定了旷工的处罚措施，包括扣除一定数额的工资，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照规章制度扣除工资可能是合法的。

2. 扣除工资的合理性：

   • 即使公司规章制度中有扣除工资的规定，扣除的数额也应当合理，不能过分高于旷工给公司造成的实际损失。
   • 如果扣除1000元工资明显超出了旷工一天或几天给公司造成的实际损失，那么这种扣除可能被视为不合理，从而不合法。

3. 法律法规的强制性规定：

   • 根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这里的“无故”指的是没有合法依据或合理理由。
   • 如果公司无法证明扣除1000元工资是基于合法、合理的规章制度，或者扣除的数额明显不合理，那么这种扣除可能被视为“无故克扣工资”，从而不合法。

行动建议：

• 核实公司规章制度：首先，你需要核实公司的规章制度中是否有关于旷工扣除工资的规定，以及该规定是否合法、合理，并经过民主程序制定且向你公示或告知。
• 评估扣除工资的合理性：其次，你需要评估扣除1000元工资是否合理，是否超出了旷工给你所在公司造成的实际损失。
• 与公司协商或投诉：如果你认为公司扣除工资不合法或不合理，你可以先与公司进行协商，要求公司说明扣除工资的依据和合理性。如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

后续思考依据：

• 在处理此类纠纷时，关键在于判断公司扣除工资的行为是否合法、合理。这需要你了解并熟悉相关法律法规和公司规章制度，以及具备评估扣除工资合理性的能力。
• 如果你对相关法律法规或公司规章制度不了解，或者无法评估扣除工资的合理性，建议你及时咨询专业律师或劳动监察部门，以获取更准确的法律意见和帮助。

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