针对您提出的“有证驾驶无牌农用车怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，有证驾驶无牌农用车同样属于违法行为，尽管您持有驾驶证，但驾驶无牌车辆上路仍然会面临相应的处罚。

一、无牌农用车上路的处罚

根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，驾驶无牌农用车上路将面临以下处罚：

1. 扣留机动车：公安机关交通管理部门有权扣留您的农用车，并通知您提供相应的牌证、标志或者补办相应手续。在您提供完备的手续后，车辆将会被及时退还。

2. 罚款：若您未能及时提供相应牌证或补办手续，公安机关交通管理部门将依照法律规定对您处以警告或者二十元以上二百元以下的罚款。

二、合并处罚的可能性

虽然您持有驾驶证，但驾驶无牌车辆上路的行为本身已经违反了交通法规。在实际执法过程中，如果您的行为同时触犯了其他交通法规（如超速、闯红灯等），公安机关交通管理部门可能会根据具体情况，对您进行合并处罚，包括但不限于罚款、扣分等。不过，就您提出的问题而言，主要关注的是无牌车辆的处罚，因此这里主要强调扣留机动车和罚款的处罚。

三、其他可能的法律后果

1. 交通事故责任：如果您在驾驶无牌农用车过程中发生交通事故，如撞伤路人或撞上其他车辆，且构成犯罪的，您将依法承担刑事责任。交通肇事罪的量刑幅度会根据事故的严重程度和您的责任大小来判定。

2. 伪造、变造或使用虚假证件的风险：我必须提醒您，千万不要试图伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证等证件。这样的行为一旦被发现，将面临更严厉的处罚，包括扣留机动车、拘留以及高额罚款，甚至可能构成犯罪被追究刑事责任。

四、建议与总结

鉴于驾驶无牌农用车的严重后果，我强烈建议您在驾驶农用车之前务必确保以下几点：

• 车辆已经合法上牌，具备有效的机动车号牌、检验合格标志、保险标志等。
• 定期检查车辆状况，确保车辆符合上路标准。
• 严格遵守交通法规，不超速、不闯红灯、不酒驾等。

遵守交通法规是每个公民的责任和义务，也是保障自身和他人安全的重要举措。希望您能够引以为戒，严格遵守交通法律法规，共同营造一个安全、有序的道路交通环境。