个体工商户变更经营者，在办理变更登记手续时，市场监督管理部门通常不收取费用。不过，具体情况还需结合以下角度分析：

1. 变更登记费用
   根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》及相关规定，市场监督管理部门对个体工商户变更经营者的登记行为本身不收取费用。这是行政机关履行法定职责的公共服务，不涉及行政收费。但需注意，若变更过程中涉及其他行政许可事项（如食品经营许可证、卫生许可证等），相关主管部门可能根据具体许可类型收取工本费或审查费，需以当地政策为准。

2. 税务处理成本
   变更经营者可能涉及税务登记信息变更。根据《中华人民共和国税收征收管理法》及实施细则，纳税人税务登记内容发生变化的，需向税务机关申报办理变更登记，此过程通常不收费。但若变更导致纳税主体、计税方式等实质性变化（如从查账征收转为核定征收），可能涉及补缴税款或调整纳税申报方式，需以税务机关核定为准。

3. 其他潜在成本

• 公证费用：若原经营者与新经营者通过协议约定债权债务承接方式，可能需对协议进行公证，公证费用由双方协商承担。
  
• 合同变更成本：若个体工商户与第三方签订的合同中约定经营者变更需经对方同意，可能涉及合同修改或补充协议签订，由此产生的律师费、差旅费等由双方协商分担。
  
• 经营资质转移成本：若个体工商户持有特定行业资质（如医疗器械经营许可证），变更经营者可能需重新申请资质或办理转移手续，相关费用由申请人承担。

建议：

1. 办理变更登记前，向当地市场监督管理部门确认是否需提交其他材料或履行前置程序；
   
2. 同步向税务机关申报税务信息变更，避免因信息滞后导致税务风险；
   
3. 若涉及合同、资质或债权债务处理，建议提前咨询专业律师，制定合法合规的变更方案。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程或法律风险。