结论：在有公证遗嘱的情况下，代位继承的适用需根据遗嘱内容及法律规定具体判断。一般来说，若遗嘱未明确排除代位继承且符合法定条件，代位继承仍有可能发生；若遗嘱明确指定继承人且未提及代位继承或明确禁止，则通常不适用代位继承。以下是对这一问题的详细分析：
一、公证遗嘱与代位继承的基本概念
公证遗嘱：是指经过国家公证机关依法认可其真实性与合法性的书面遗嘱。它是遗嘱的一种形式，具有较高的法律效力，通常优先于其他形式的遗嘱。在继承开始后，应首先按照公证遗嘱的内容进行遗产分配。
代位继承：是指在法定继承中，当某个继承人（被代位继承人）先于被继承人死亡时，由该继承人的晚辈直系血亲代替其继承应得的遗产份额。代位继承仅适用于法定继承，且需满足一定的条件，如被代位继承人必须先于被继承人死亡，代位继承人必须是被代位继承人的晚辈直系血亲等。
二、公证遗嘱对代位继承的影响
遗嘱指定继承的情况：
- 若公证遗嘱明确指定了由被继承人的某子女或兄弟姐妹继承遗产，但该子女或兄弟姐妹先于被继承人死亡，此时遗嘱中所指定的遗产份额将按遗嘱执行。若遗嘱未提及代位继承或明确禁止代位继承，则通常不发生代位继承，因为遗嘱已经明确了具体的继承人，且代位继承仅适用于法定继承。
- 然而，如果遗嘱中虽然指定了继承人，但同时也明确表示允许在特定情况下（如继承人死亡）由其他亲属（如晚辈直系血亲）代位继承，那么代位继承在符合遗嘱规定的条件下可以发生。
遗嘱未涉及部分的情况：
- 如果公证遗嘱并未涉及被继承人的全部遗产，即存在未通过遗嘱处分的遗产部分，那么对于这部分遗产，将按照法定继承的规则进行处理。在此情况下，如果符合代位继承的条件，代位继承人可以依法进行代位继承。
三、实际应用中的考虑因素
在处理有公证遗嘱情况下的代位继承问题时，应综合考虑以下因素：
- 遗嘱的具体内容：包括是否明确指定继承人、是否提及代位继承及是否设置相关条件。这是判断代位继承是否适用的关键依据。
- 遗嘱继承人的状况：包括是否健在、是否放弃继承权或丧失继承权等。这些因素可能影响遗产的分配方式，进而影响代位继承的适用。
- 法律规定：特别是关于代位继承和遗嘱继承的相关条款。在处理此类问题时，必须严格遵守法律规定，确保遗产分配的合法性和公正性。
四、实例说明
假设甲立有一份公证遗嘱，指定其全部遗产由其子乙继承。然而，在遗嘱生效前，乙不幸去世，且留有儿子丙。在这种情况下：
- 如果遗嘱中未提及代位继承或明确禁止代位继承，则丙通常无法代位继承甲的遗产，因为遗嘱已经明确了由乙继承全部遗产。
- 如果遗嘱中明确表示允许在乙死亡的情况下由丙代位继承，或者遗嘱未涉及全部遗产且存在未处分的部分，则丙在符合代位继承条件的情况下可以代位继承甲的遗产。
建议：在处理涉及公证遗嘱和代位继承的遗产分配问题时，建议仔细审查遗嘱内容，并咨询专业律师以获取针对具体情况的法律意见和指导。如果你有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。