农村土地确权后，儿子继承的处理方式需根据土地性质及确权情况分情况讨论，具体如下：

1. 若土地为宅基地使用权
   根据《民法典》第362条及《土地管理法》第62条，宅基地使用权具有人身依附性，不能单独继承。但若儿子作为集体经济组织成员，且符合“一户一宅”原则，可依法申请继承宅基地上的房屋，并因“房地一体”原则取得宅基地使用权。

   • 操作流程：需办理房屋继承公证或诉讼确认继承权，再凭生效法律文书向不动产登记机构申请宅基地使用权及房屋所有权变更登记。
     
   • 限制条件：若儿子已拥有其他宅基地，或非本集体经济组织成员（如城镇户籍），则仅能继承房屋所有权，宅基地使用权由集体收回，房屋自然灭失后不得翻建。

2. 若土地为承包地经营权
   根据《农村土地承包法》第32条及《民法典》第1127条，承包地经营权可继承，但需区分土地类型：

   • 家庭承包方式取得的耕地、草地承包经营权：
     若承包期内家庭成员全部死亡（即“整户消亡”），承包地由集体收回；若部分家庭成员死亡，其他成员继续承包，不发生继承。但若儿子作为共有人，可在共有人范围内协商分割承包地经营权。
     
   • 以其他方式（如招标、拍卖、公开协商）取得的“四荒地”经营权：
     承包期内可依法继承，儿子需凭继承权证明文件与发包方重新签订承包合同，并办理土地经营权变更登记。

3. 若土地为自留地、自留山使用权
   自留地、自留山属农民集体所有，使用权不纳入继承范围。但若地上有附着物（如树木、农作物），儿子可继承附着物的所有权，并因“地随物走”原则在附着物存续期间继续使用土地，附着物灭失后土地由集体收回。

风险提示与建议：

• 继承前需确认土地权属证书（如《农村土地承包经营权证》《宅基地使用证》）是否已变更至被继承人名下，避免因权属争议导致继承无效。
  
• 若涉及跨集体经济组织继承（如儿子户籍迁出），需提前与发包方或集体协商，部分地区可能要求签订土地流转协议或缴纳有偿使用费。
  
• 建议在继承过程中同步办理土地权属变更登记，避免因未登记导致权益受损。
  

如有具体案件细节（如土地类型、继承人户籍、被继承人死亡时间等），可进一步向我咨询，我将结合地方政策提供针对性方案。