行政许可被撤销的机关主要包括作出行政许可决定的行政机关以及其上级行政机关。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国行政许可法》第六十九条的规定，有下列情形之一的，作出行政许可决定的行政机关或者其上级行政机关，根据利害关系人的请求或者依据职权，可以撤销行政许可：

1. 行政机关违法作出许可决定：

   • 行政机关工作人员滥用职权、玩忽职守作出准予行政许可决定的。
   • 超越法定职权作出准予行政许可决定的。
   • 违反法定程序作出准予行政许可决定的。
   • 对不具备申请资格或者不符合法定条件的申请人准予行政许可的。

2. 被许可人以不正当手段取得许可：

   • 被许可人以欺骗、贿赂等不正当手段取得行政许可的，应当予以撤销。

二、撤销机关的具体解释

1. 作出行政许可决定的行政机关：

   • 这是最直接的撤销机关。当行政机关发现自身在作出行政许可决定时存在违法行为或错误时，有权自行撤销该许可。

2. 上级行政机关：

   • 上级行政机关对下级行政机关的行政许可决定具有监督权。当下级行政机关作出的行政许可决定存在违法行为或错误时，上级行政机关可以依据职权或利害关系人的请求撤销该许可。

三、撤销行政许可的注意事项

1. 公共利益保护：

   • 依照上述规定撤销行政许可时，若撤销可能对公共利益造成重大损害，则不予撤销。这是为了平衡行政许可的合法性与公共利益的保护。

2. 被许可人合法权益保护：

   • 因行政机关自身原因导致许可被撤销，使被许可人的合法权益受到损害的，行政机关应依法给予赔偿。这是为了保障被许可人的合法权益不受非法侵害。

3. 不正当手段取得许可的处理：

   • 因被许可人以不正当手段取得许可被撤销的，被许可人不仅无法获得赔偿，其基于行政许可取得的利益也不受保护。这是为了维护行政许可的公正性和合法性，防止不正当手段获取许可的行为。

四、实例说明

假设某企业通过贿赂行政机关工作人员的方式获得了某项行政许可，后来这一行为被发现。在这种情况下，作出该行政许可决定的行政机关或者其上级行政机关都有权撤销该许可，并且该企业基于该许可取得的利益将不受法律保护。

总结来说，行政许可被撤销的机关主要包括作出行政许可决定的行政机关以及其上级行政机关。在撤销行政许可时，需要综合考虑公共利益的保护、被许可人合法权益的保护以及不正当手段取得许可的处理等因素。如果您在行政许可方面遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。