摩托车在非机动车道等红绿灯时被电动车追尾，责任认定需根据具体情况综合分析，以下为不同情况下的责任划分：

1. 摩托车正常行驶且无违法行为

   • 责任认定：若摩托车在非机动车道等红绿灯时，完全遵守交通规则，且电动车追尾是由于电动车驾驶人未保持安全距离、未注意观察前方情况或操作不当等原因导致，那么电动车驾驶人通常应承担主要或全部责任。因为在此情况下，摩托车驾驶人已尽到安全注意义务，而电动车驾驶人未履行其应尽的安全保障义务。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，非机动车驾驶人应当遵守交通规则，确保行车安全。若因非机动车驾驶人的过错导致交通事故，应承担相应责任。

2. 摩托车存在违法行为

   • 责任认定：若摩托车违规进入非机动车道行驶，即使是在等红绿灯时，也违反了交通法规。在此情况下，若电动车追尾，摩托车驾驶人通常需要承担主要责任或同等责任。因为摩托车驾驶人的违法行为增加了碰撞风险，是事故发生的一个重要因素。
   • 特殊情况：如果摩托车在非机动车道行驶时还存在其他违法行为，如超速、超载、车辆故障未及时处理等，且这些违法行为与事故发生存在因果关系，那么摩托车驾驶人需承担的责任将更大，具体责任大小根据过错程度确定。
   • 法律依据：同样依据《中华人民共和国道路交通安全法》，机动车不得违规进入非机动车道行驶，违反者将承担相应法律责任。

3. 特殊情况：摩托车违停

   • 责任认定：如果摩托车在非机动车道上违停等红绿灯，这本身就是违法的。因此，若电动车追尾违停的摩托车，摩托车需负主要责任。因为摩托车驾驶人的违停行为直接导致了事故的发生。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的规定，机动车在非机动车道上停放是违法的，违反者将受到处罚，并在事故中承担相应责任。

4. 意外情况

   • 责任认定：若双方均无违章行为，而是由于不可抗力因素（如路面湿滑、能见度低等）导致的追尾，那么可能会根据公平原则，由双方分担责任。但这种情况较为罕见，且需要具体证据支持。
   • 处理建议：在发生此类事故时，应及时报警并联系保险公司。由交警部门进行现场勘查并出具事故认定书，以确定双方的责任划分。

后续处理建议：

• 在发生交通事故后，无论责任如何划分，都应首先确保人员安全，并及时报警。
• 等待交警部门到场勘查并出具事故认定书，这是确定双方责任的重要依据。
• 根据事故认定书的结果，与对方协商赔偿事宜或通过法律途径解决纠纷。
• 如有需要，可以联系保险公司进行理赔申请。

总结与提醒： 摩托车在非机动车道等红绿灯时被电动车追尾的责任认定是一个复杂的过程，需要综合考虑多种因素。在实际操作中，应确保责任划分的公正性和合理性，以保障各方当事人的合法权益。如果您对此类事故有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。