当股东丧失民事行为能力，而其他股东不同意由其监护人代行职权时，这是一个涉及公司法、监护法以及公司内部治理结构的复杂问题。以下是对此问题的详细解答：
一、股东丧失民事行为能力的法律后果
股东丧失民事行为能力后，其原本享有的股东权利（如表决权、分红权等）并不会因此自动消失或转移。然而，由于该股东已无法亲自行使这些权利，因此需要由其法定监护人代为行使。这是基于监护制度的基本原则，即保护无民事行为能力人或限制民事行为能力人的合法权益。
二、监护人代行股东职权的法律依据
虽然《中华人民共和国公司法》并未直接规定股东丧失民事行为能力后，其监护人应如何代行股东职权，但可以根据相关法律原则和规定进行推断。特别是《公司法》中关于股东资格承继和股东权利行使的规定，以及《民法典》中关于监护制度的规定，为处理此类问题提供了法律依据。
股东资格承继：虽然《公司法》第九十条主要规定的是自然人股东死亡后其合法继承人可以继承股东资格，但这一规定可以类比适用于股东丧失民事行为能力的情况。即，股东丧失民事行为能力后，其监护人应可以代表该股东行使股东权利，除非公司章程另有规定。
监护制度：根据《民法典》的规定，监护人的职责是代理被监护人实施民事法律行为，保护被监护人的人身权利、财产权利以及其他合法权益等。因此，在股东丧失民事行为能力的情况下，其监护人有权代为行使股东权利。
三、其他股东不同意监护人代行职权的处理
当其他股东不同意由丧失民事行为能力股东的监护人代行职权时，可以采取以下措施：
协商解决：首先，各方应尝试通过协商达成一致意见。这可能包括修改公司章程、制定新的内部治理规则或达成其他协议，以明确监护人代行股东职权的具体方式和范围。
召开股东会或董事会：如果协商无果，可以按照公司章程或公司法的规定召开股东会或董事会，就丧失民事行为能力股东的监护人代行职权问题进行表决。在表决过程中，应确保所有股东的合法权益得到充分保障，并遵循公司章程和公司法的相关规定。
寻求法律救济：如果无法通过协商或股东会、董事会解决争议，相关方可以寻求法律救济。例如，可以向法院提起诉讼，请求法院对争议问题进行裁决。在诉讼过程中，法院将根据相关法律法规和案件事实进行审理，并作出公正判决。
四、特殊情况下的处理
在公司陷入僵局、无法召开股东会或董事会的情况下，如果大股东丧失民事行为能力且其监护人无法代行职权，而小股东又不同意由其他人代行职权时，可以考虑以下方案：
由法院指定临时管理人：在特定情况下，法院可以根据相关方的申请指定临时管理人负责公司的日常经营管理事务。这可以确保公司在争议期间能够正常运营，并保护所有股东的合法权益。
寻求公司解散或重组：如果争议无法得到妥善解决且公司无法继续正常运营，相关方可以考虑寻求公司解散或重组等法律途径来解决问题。这可能需要遵循公司法的相关规定和程序进行操作。
五、结论与建议
综上所述，当股东丧失民事行为能力且其他股东不同意由其监护人代行职权时，应首先尝试通过协商解决争议。如果协商无果，可以按照公司章程或公司法的规定召开股东会或董事会进行表决。在特殊情况下，可以考虑寻求法律救济或由法院指定临时管理人等方案来解决问题。为了避免类似争议的发生，建议公司在制定章程时明确规定股东丧失民事行为能力后的处理方式和监护人代行职权的具体规则。