结论前置：员工在职期间完全有权依法申请劳动仲裁来维护自己的合法权益，这一权利受到我国法律的明确保护。
一、法律依据与仲裁范围
根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，该法适用于中华人民共和国境内的用人单位与劳动者之间因确认劳动关系、订立、履行、变更、解除和终止劳动合同、工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护、劳动报酬等发生的多种劳动争议。这意味着，无论员工是否在职，只要存在上述争议情形之一，都有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
二、常见可申请劳动仲裁的情形
薪酬福利纠纷：
- 用人单位无故拖欠工资、克扣工资。
- 未依法为劳动者缴纳社会保险费用，如养老保险、医疗保险等。
- 未提供约定的带薪年假等福利待遇。
工作时间和休息休假纠纷：
- 安排加班但未支付加班工资。
- 不批准员工依法应享受的年假、病假等假期。
劳动合同纠纷：
- 用人单位未经协商擅自调整工作岗位或降低工资待遇。
- 违法解除或终止劳动合同。
三、申请劳动仲裁的流程与材料
提交书面申请：
- 劳动者需填写仲裁申请书，写明基本信息、仲裁请求、事实理由及证据来源等，并按照被申请人人数提交副本。
准备相关材料：
- 身份证复印件。
- 相关证据复印件及清单，如劳动合同、工资条、考勤记录、社会保险缴纳记录等。
- 用人单位工商登记信息（可通过国家企业信用信息公示系统查询并打印）。
立案与审理：
- 携带所需材料到劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请立案。
- 仲裁委员会在收到申请后五日内进行审查，符合受理条件的将予以受理，并通知申请人；不符合条件的，将书面通知不予受理并说明理由。
- 仲裁庭将在开庭前五日通知双方当事人开庭日期和地点。如有正当理由，当事人可在开庭前三日申请延期开庭，由仲裁委员会决定是否准许。
- 仲裁庭在作出裁决前会尝试进行调解。若调解成功，将制作调解书；若调解不成或调解书送达前一方反悔，仲裁庭将及时作出公正裁决。
四、申请劳动仲裁的时效与条件
仲裁时效：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。
- 但需注意，因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者在职期间申请仲裁不受此限制；劳动关系终止后，则应在一年内提出。
仲裁条件：
- 劳动者需确保争议属于劳动仲裁受理范围。
- 向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提出申请，一般由劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会管辖。
五、后续处理与注意事项
结案时间：
- 劳动仲裁一般60天内结案。对裁决书不服的，劳动者可在收到之日起15天内向人民法院提起诉讼。
继续工作：
- 在申请劳动仲裁期间，劳动者可以继续在原单位工作，但需遵守劳动合同约定，不得故意损害对方合法权益。
权衡利弊与收集证据：
- 申请仲裁前，劳动者应权衡利弊，考虑可能的影响，如与用人单位的关系紧张可能带来的后果等。
- 务必收集充分证据以支持自己的仲裁请求，如劳动合同、工资条、考勤记录、社会保险缴纳记录等。
总结与建议：员工在职期间申请劳动仲裁是其依法享有的权利，旨在保障劳动者的合法权益不受侵害。在申请过程中，劳动者应了解相关法律法规，遵循正确的申请流程，并注重证据的收集与保留。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询，我会尽我所能为你提供专业的法律支持。