结论：案件终本后，如果被执行人存在特定妨碍执行的行为，申请执行人仍然有权申请对其采取司法拘留措施。
一、案件终本的含义与影响
首先，我们需要明确“终本”即“终结本次执行程序”的含义。在执行程序中，当法院已经采取所有可能的执行措施，但未发现被执行人有可供执行的财产时，法院会裁定终结本次执行程序。这并不意味着案件的彻底终结或被执行人法律义务的免除，而是一种暂时的结案方式。被执行人仍需承担生效法律文书所确定的义务，且法院对被执行人所采取的很多强制措施，如列入失信被执行人名单、限制消费等，依然保持有效。
二、终本后申请司法拘留的情形
在案件终本后，如果被执行人存在以下特定妨碍执行的行为，申请执行人可以申请对其采取司法拘留措施：
有能力执行而拒不执行：被执行人实际具备执行能力，却故意隐藏、转移财产或采取其他手段规避执行，严重妨碍司法秩序和申请执行人的合法权益。
违反限制消费令：终本后，被执行人需遵守法院颁发的限制消费令，禁止进行高消费及非生活和工作必需的消费行为。如违反此令，如乘坐飞机头等舱、入住星级宾馆等，法院将依法对其进行拘留。
拒不报告或虚假报告财产：被执行人负有向法院如实报告财产状况的义务。若终本后仍拒绝报告或提供虚假报告，法院有权对其实施拘留，以维护司法权威和申请执行人的权益。
三、申请司法拘留的流程
收集证据：申请执行人在申请拘留前，必须收集充分的证据，以证明被执行人有履行能力却拒不履行法律义务。这些证据可以包括财产线索、拒不执行行为证据等。
撰写并提交申请书：在申请书中，应详细说明申请拘留被执行人的事实和理由，包括被执行人的基本情况、拒不履行的具体事实、给申请执行人造成的损害以及对司法秩序的影响。同时，附上收集到的所有证据材料清单及说明。将写好的申请书递交给负责执行的法院执行部门。
法院审查与决定：法院收到申请后，会对申请内容和证据进行全面审查。如果法院经审查认为被执行人符合拘留条件，将作出拘留决定书。拘留的期限一般不超过十五日。
执行拘留措施：拘留决定作出后，由法院的司法警察或其他执行人员负责具体的拘留执行工作。他们会按照法定程序找到被执行人，出示拘留决定书，并将其带至指定的拘留场所执行拘留。
四、终本后的其他执行措施与恢复执行
除了申请司法拘留外，申请执行人在案件终本后还可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
定期查询财产：即使案件终本，法院仍会定期查询被执行人的财产情况。一旦发现可供执行的财产线索，法院将依职权恢复执行。
申请恢复执行：申请执行人在发现被执行人有可供执行的财产时，可以随时向法院申请恢复执行，且不受申请执行时效期间的限制。
五、注意事项
遵守法律程序：申请执行人在申请拘留过程中，必须遵守法律程序和规定，避免因违法操作而导致申请被驳回。
复议权利：如果被执行人对拘留决定不服，可以在规定的期限内向上一级法院申请复议。
总结与建议：案件终本后，申请执行人仍然有权申请对被执行人采取司法拘留措施，如果其存在特定妨碍执行的行为。同时，申请执行人也应密切关注被执行人的财产状况，及时行使自己的权利，申请恢复执行以保障自身权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。