关于第三方在医院采集脐带血是否合法的问题，这主要取决于该第三方是否获得了相关部门的批准和许可。

首先，根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理非法采供血液等刑事案件具体应用法律若干问题的解释》，未经国家主管部门批准或者超过批准的业务范围，采集、供应血液或者制作、供应血液制品的，应认定为非法采集、供应血液或者制作、供应血液制品，这是违法的行为。这意味着，如果第三方没有获得国家主管部门的批准，就在医院采集脐带血，那么这种行为就是非法的。

其次，卫生部办公厅发布的《关于加强脐带血造血干细胞管理工作的通知》也明确指出，未经批准，任何机构不得开展脐带血造血干细胞采集和脐带血造血干细胞治疗技术临床应用工作。这进一步强调了批准和许可的重要性。

在实际操作中，合法的脐带血采集通常是由经过批准的脐带血库或者相关医疗机构进行的。这些机构有严格的质量管理和安全控制措施，能够确保脐带血的采集、运输、制备、检测、储存和发放等全过程都符合规定，从而保障供者和受者的权益。

因此，如果第三方想要在医院采集脐带血，必须首先获得国家主管部门的批准和许可，并遵守相关的法律法规和操作规范。否则，这种行为就是非法的，可能会面临法律的制裁。

总的来说，第三方在医院采集脐带血的合法性取决于其是否获得了相关部门的批准和许可。如果没有获得批准和许可，那么这种行为就是非法的。所以，在选择脐带血采集机构时，一定要选择经过批准和许可的合法机构，以确保自己的权益得到保障。