结论：您遇到的“车辆违法已处理但是电子版行驶证违法未处理”的情况，通常意味着车辆的实际违法行为已经处理完毕，但电子版行驶证上的违法记录可能由于系统更新延迟、数据同步问题或处理流程未完全结束等原因，尚未及时更新或消除。

详细分析：

1. 系统更新延迟：

   • 在处理交通违法行为后，相关数据需要从处理机构传输到交通管理部门的数据库，并进一步更新到电子版行驶证系统中。这个过程可能需要一定的时间，如果在此期间查询电子版行驶证，可能会看到旧的违法记录。

2. 数据同步问题：

   • 不同系统之间的数据同步可能存在延迟或错误。例如，处理机构可能已经更新了其内部系统，但交通管理部门的系统尚未接收到这些更新，或者接收到了错误的数据，导致电子版行驶证上的违法记录未及时消除。

3. 处理流程未完全结束：

   • 某些交通违法行为的处理可能涉及多个步骤，如缴纳罚款、参加交通安全教育等。如果其中任何一个步骤未完成，即使已经缴纳了罚款，电子版行驶证上的违法记录也可能不会立即消除。

建议措施：

1. 等待一段时间后再次查询：

   • 由于系统更新和数据同步可能需要时间，建议您在处理违法行为后等待一段时间（如几天或一周），然后再次查询电子版行驶证，看违法记录是否已更新。

2. 联系交通管理部门：

   • 如果等待一段时间后违法记录仍未更新，您可以联系当地的交通管理部门（如交警队或车管所），咨询具体情况并请求他们协助更新电子版行驶证上的违法记录。

3. 保留处理凭证：

   • 在处理交通违法行为时，请务必保留好相关的处理凭证（如罚款收据、处理决定书等）。这些凭证可以作为您已经处理违法行为的证明，以防在电子版行驶证更新延迟或数据同步问题时出现纠纷。

法律背景：

• 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，交通违法行为处理后，相关记录应当及时更新并消除。如果由于系统原因或数据同步问题导致记录未及时更新，交通管理部门有责任协助解决。

后续行动：

• 如果您按照上述建议操作后问题仍未解决，或者您对交通违法行为的处理流程、电子版行驶证的使用等有任何疑问，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和帮助。