软件著作权可以保护后续版本，但需分情况讨论，具体如下：

1. 若后续版本属于原作品的“演绎作品”
   根据《著作权法》第十三条，改编、翻译、注释、整理已有作品而产生的作品（即演绎作品），其著作权由演绎者享有，但行使著作权时不得侵犯原作品的著作权。

   • 保护逻辑：若后续版本是在原软件基础上进行修改、升级（如增加功能、优化代码），且修改部分具有独创性，则后续版本可独立构成新作品，受著作权法保护。
     
   • 限制条件：原软件著作权人仍有权禁止他人未经许可复制、发行原作品或后续版本中属于原作品的部分。例如，若后续版本直接复制了原代码的核心逻辑，可能侵犯原著作权。

2. 若后续版本属于原作品的“复制件”或“简单修改”

   • 保护逻辑：若后续版本仅是对原软件的复制（如重新编译、格式转换）或非独创性修改（如修正拼写错误、调整界面布局），则不构成新作品，无法单独获得著作权保护。
     
   • 例外情形：若修改部分达到“独创性”标准（如完全重写核心算法、设计全新架构），则可能被认定为新作品，但需注意与原作品的界限，避免侵权。

3. 合同或授权协议的优先性

   • 若原软件通过许可协议（如开源协议、商业授权）允许他人修改或分发，则后续版本的保护范围需受协议约束。例如：
     
     • 开源软件：若原软件采用GPL协议，后续版本必须同样开源；若采用MIT协议，则允许闭源修改。
       
     • 商业授权：若授权协议明确约定后续版本的归属（如归原著作权人或被授权人），则以协议为准。

实务建议：

• 明确版本关系：在开发后续版本时，建议通过版本控制系统（如Git）记录修改内容，区分独创性部分与原作品部分。
  
• 签订书面协议：若涉及合作开发或授权，务必签订书面合同，明确后续版本的著作权归属及使用范围。
  
• 及时登记著作权：对后续版本中具有独创性的部分，可单独申请软件著作权登记，以增强权利证明力。
  

如有具体案例或合同条款需要分析，可直接向我咨询。