是的，涉企案件包括被害人是企业的案件。涉企案件是一个广泛的概念，它涵盖了涉及企业的多个方面和多种类型的案件。以下是对这一问题的详细分析：

一、涉企案件的定义与范围

涉企案件是指涉及企业（包括但不限于国有独资企业、国有控股企业、个人独资企业、合伙企业、有限责任公司和股份有限公司等）或其法定代表人、所有人、实际控制人、股东及高级经营、管理人员作为受害人、嫌疑人或财物被查封、扣押、冻结的持有人的各类案件。这些案件不仅涉及民事领域，如合同纠纷、知识产权纠纷、股权纠纷等，还涉及刑事领域，如经济犯罪、职务犯罪等，以及行政领域，如行政处罚、行政许可与审批等。

二、被害人是企业的涉企案件类型

1. 民事案件中的被害企业：

   • 在合同纠纷中，如果企业作为合同的一方，因对方违约或履行不当而遭受损失，那么该企业就是被害方。
   • 在知识产权纠纷中，如果企业的商标、专利等知识产权被侵权，企业同样可以作为被害方提起诉讼。

2. 刑事案件中的被害企业：

   • 在经济犯罪中，如合同诈骗、偷税漏税等，如果企业是犯罪行为的直接受害者，如被骗取财物或遭受经济损失，那么企业就是被害方。
   • 在职务犯罪中，虽然犯罪行为通常由企业内部人员实施，但如果这些行为给企业造成了经济损失或名誉损害，企业也可以视为被害方。

3. 行政案件中的被害企业（此处的“被害”更多指权益受损）：

   • 在行政处罚案件中，如果企业因违反相关法律法规而受到处罚，虽然企业不是传统意义上的“被害方”，但企业的权益确实受到了损害，且这类案件也涉及企业，因此可以纳入涉企案件的范畴。不过，在更严格的定义下，行政案件中的“被害”可能更多指的是企业作为行政相对人其合法权益受到行政行为侵害的情况，如行政许可被违法撤销等。

三、处理原则与建议

1. 依法处理：无论是民事、刑事还是行政案件，都应严格遵循相关法律法规进行处理，确保企业的合法权益得到保护。

2. 加强防范：企业应建立健全内部管理制度，加强法律风险防范意识，及时发现和应对各类违法犯罪行为，减少成为被害方的风险。

3. 及时维权：如果企业不幸成为被害方，应及时采取措施维护自身权益，如报警、提起诉讼等。

4. 寻求专业帮助：在处理涉企案件时，企业可以寻求专业律师的帮助，以确保案件得到妥善处理。

综上所述，涉企案件确实包括被害人是企业的案件。这类案件具有复杂性和多样性，需要企业、公安机关和相关部门共同努力，依法依规进行处理，以保护企业的合法权益和维护良好的市场经济秩序。如果你有任何关于涉企案件的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。