保密协议并非必须一式两份才具有法律效力。其生效的关键在于满足法律规定的合同成立和生效要件，而非协议的份数。以下是对此问题的详细分析：

一、保密协议的生效条件

1. 双方真实意思表示：保密协议必须是双方当事人自愿达成的，不存在欺诈、胁迫等情形。这是合同成立的基本前提，也是保密协议生效的基础。

2. 不违反法律法规：协议内容不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。这是合同合法性的基本要求，也是保密协议能够得到法律保护的前提。

3. 具备基本条款：虽然法律没有明确规定保密协议必须具备哪些具体条款，但通常应包括保密信息的定义、保密义务、保密期限、违约责任等基本内容。这些条款是保密协议的核心，也是双方履行协议和解决纠纷的依据。

4. 形式要求：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。对于保密协议而言，为了明确双方的权利和义务，建议采用书面形式。然而，书面形式并不等同于必须一式两份或多份，关键在于能够清晰证明双方的意思表示和协议内容。

二、关于“一式两份”的理解

• “一式两份”是实践中常见的做法，主要是为了方便双方各执一份，作为履行协议和解决纠纷的依据。但这并不是保密协议生效的必要条件。
• 如果只有一份保密协议，且该协议能够清晰证明双方的意思表示和协议内容，同时满足上述生效条件，那么这份协议同样具有法律效力。

三、实际操作中的建议

1. 份数确定：在签订保密协议时，双方应根据实际需要确定协议的份数。如果涉及多方主体或需要存档备案，可能会制作多份协议。但无论份数多少，都应确保每份协议都经过正式签署和盖章，以保证其法律效力。

2. 保管与备份：为了确保双方的权益得到充分保障，建议双方各执一份协议原件或复印件（经核对无误后加盖骑缝章等方式确认与原件一致）。如果因特殊原因只能有一份协议原件，双方应妥善保管并协商确定其他方式（如拍照留存、扫描存档等）来确保各自能够随时查阅协议内容。

3. 协议内容完善：在签订保密协议时，双方应仔细审查协议内容，确保保密信息的定义明确、保密义务具体、保密期限合理、违约责任清晰。这样可以在发生纠纷时，为双方提供明确的法律依据和解决方案。

综上所述，保密协议的份数并非其生效的绝对条件。关键在于双方的一致意思表示、协议内容的合法性以及协议的签订方式。只要满足这些条件，无论保密协议是一份还是多份，都具有相同的法律效力。如果您在签订保密协议过程中遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。