1. 核心结论：货物运到甲方后遇大雨灭失，责任承担需根据运输合同约定、货物交付情况、不可抗力因素及双方过错综合判断。

2. 分情况说明：

   • 情况一：货物已交付甲方
     若货物已按合同约定完成交付（如签收、验收等），则风险转移至甲方。此时因大雨导致货物灭失，原则上由甲方承担损失，除非能证明乙方（承运人/卖方）存在过错（如未妥善包装、未尽到保管义务等）。
     法律依据：根据《民法典》第六百零四条，标的物毁损、灭失的风险，在标的物交付之前由出卖人承担，交付之后由买受人承担。

   • 情况二：货物未交付甲方
     若货物尚未完成交付（如仍在运输途中、未验收等），则风险仍由乙方承担。但若大雨属于不可抗力（如暴雨达到当地气象部门认定的灾害标准），且乙方已尽到合理防护义务（如采取遮盖、排水等措施），可部分或全部免除责任。
     法律依据：根据《民法典》第五百九十条，当事人一方因不可抗力不能履行合同的，根据不可抗力的影响，部分或者全部免除责任，但法律另有规定的除外。

   • 情况三：合同对风险转移有特殊约定
     若运输合同或买卖合同中明确约定了风险转移时间（如“货交第一承运人后风险转移”），则按合同约定处理。此时即使货物未到达甲方，风险也可能已转移至甲方。
     法律依据：根据《民法典》第六百零六条，当事人可以约定标的物交付地点、交付时间及风险转移规则，约定优先于法定。

3. 实务建议：

   • 乙方（承运人/卖方）：
     
     • 立即固定证据（如现场照片、气象证明、运输记录等），证明灭失原因及已尽义务；
       
     • 通知甲方并协商解决方案，避免因拖延导致责任扩大；
       
     • 若涉及保险，及时向保险公司报案并配合理赔。
       
   • 甲方（收货人/买方）：
     
     • 检查货物是否已按合同约定交付，若未交付可要求乙方承担责任；
       
     • 若已交付但怀疑乙方存在过错（如包装不当），可要求乙方赔偿；
       
     • 协商不成时，可依据合同约定或法律规定向法院起诉。

如有进一步细节（如合同条款、灭失程度等），可向我补充说明，我会为您具体分析。