结论是：货不合格赔偿后，是否还需要写协议，这取决于具体情况和双方的需求，但一般来说，为了明确双方的权利义务、避免后续纠纷，建议签订书面协议。以下从不同角度进行分析：
一、从法律效力的角度
口头协议与书面协议的区别：
- 口头协议虽然也具有一定的法律效力，但在发生纠纷时，往往因为证据不足而难以维权。
- 书面协议则能够明确、具体地记载双方的权利义务，是更为可靠和有力的证据。在货物不合格赔偿后，如果双方就赔偿事宜、后续责任等达成一致，签订书面协议可以确保这些约定得到法律的保护。
法律对书面协议的要求：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。但涉及重大利益或容易产生纠纷的合同，建议采用书面形式。
- 在货物买卖合同纠纷中，如果货物不合格导致赔偿，这通常涉及较大的经济利益和复杂的责任划分，因此签订书面协议是更为稳妥的选择。
二、从实际操作的层面
明确赔偿细节：
- 赔偿协议可以详细记录货物不合格的具体情况、赔偿金额、支付方式、支付时间等关键信息，避免双方因记忆模糊或理解差异而产生纠纷。
- 例如，如果赔偿是分期支付的，协议中应明确每期的支付金额、支付时间以及逾期支付的违约责任等。
规定后续责任：
- 除了赔偿事宜外，协议还可以规定双方在赔偿后的其他责任和义务，如退货、换货、维修等。
- 这有助于确保双方在赔偿后能够继续履行合同中的其他条款，维护交易的稳定性和公平性。
作为纠纷解决的依据：
- 如果双方在赔偿后再次发生纠纷，书面协议可以作为解决纠纷的重要依据。法院或仲裁机构在审理案件时，通常会优先考虑书面协议中的约定。
三、从风险防范的角度
避免口头约定的不确定性：
- 口头约定往往因为缺乏明确的记录而容易产生争议。在货物不合格赔偿后，如果双方仅通过口头方式达成协议，一旦一方反悔或记忆模糊，就可能导致纠纷的发生。
- 签订书面协议可以消除这种不确定性，确保双方的约定得到明确的记录和确认。
保护自身权益：
- 对于赔偿方来说，签订书面协议可以确保自己按照约定履行了赔偿义务，避免被对方无端指责或要求额外赔偿。
- 对于受赔偿方来说，书面协议则可以作为自己接受赔偿的凭证，确保自己的权益得到保障。
建议：在货物不合格赔偿后，为了明确双方的权利义务、避免后续纠纷，建议双方签订书面协议。协议内容应详细、具体，包括赔偿金额、支付方式、支付时间、后续责任等关键信息。如果双方对协议内容存在争议或不确定如何起草协议，可以寻求专业律师的帮助，以确保协议的合法性和有效性。如果有任何法律问题，也可以直接向我咨询。