结论：在未成年被未成年在学校厕所被迫发生性关系且没有直接证据的情况下，协商解决将面临极大困难。但可以从收集间接证据、寻求学校及警方帮助、考虑法律途径等角度入手，尽力维护受害未成年人的权益。
分析说明：
证据收集的重要性与困难：
- 在此类案件中，直接证据（如监控录像、目击者证言等）往往至关重要。然而，若缺乏这些直接证据，协商解决将变得极为棘手。
- 尽管如此，仍应尽力收集间接证据，如受害未成年人的陈述、身体检查报告（如有伤痕或疾病）、心理评估报告（显示受害者可能遭受的心理创伤）、与加害者的通信记录（如有）等。这些间接证据虽不如直接证据有力，但在协商或法律程序中仍可能发挥一定作用。
寻求学校及警方的帮助：
- 学校作为教育机构，有责任保护学生的安全。在发生此类事件后，应立即向学校报告，并要求学校采取必要措施，如调查事件、保护受害者隐私、提供心理支持等。
- 同时，应向当地警方报案。警方有专业手段进行调查，包括询问相关人员、收集证据等。即使最终无法以刑事案件立案，警方的调查记录也可能为后续的协商或民事诉讼提供有力支持。
协商解决的可能性与限制：
- 在缺乏直接证据的情况下，协商解决可能面临加害方否认、拒绝承担责任等困难。但若加害方或其家长愿意承担一定责任（如道歉、赔偿等），且受害方接受，则协商解决仍是一种可能的选择。
- 协商解决时，应确保受害未成年人的权益得到充分保障。这包括但不限于获得合理的赔偿、确保加害方不再对受害者造成威胁或伤害等。
考虑法律途径：
- 若协商解决无果，或加害方拒绝承担责任，受害方应考虑通过法律途径维护自身权益。这可能包括提起民事诉讼，要求加害方承担民事赔偿责任；或依据相关法律法规，要求学校、警方等机构承担相应责任。
- 在提起诉讼前，应咨询专业律师，了解诉讼程序、可能的结果及风险等。律师将能够根据具体情况提供有针对性的法律建议。
行动建议：
- 立即收集证据：包括受害者的陈述、身体检查报告、心理评估报告等。
- 向学校及警方报告：要求学校采取必要措施保护受害者，并请求警方进行调查。
- 尝试协商解决：在律师的协助下，与加害方或其家长进行协商，力求达成双方都能接受的解决方案。
- 考虑法律途径：若协商无果，及时咨询律师，了解提起诉讼的可能性及程序。
特殊场景：
- 若加害方也是未成年人，且年龄较小，可能不承担刑事责任，但仍需承担民事赔偿责任。此时，协商解决或提起民事诉讼仍是可行的选择。
- 若受害者因事件遭受严重心理创伤，应及时寻求专业心理治疗，并在协商或诉讼中要求加害方承担相应的心理治疗费用。
后续思考依据：
- 在处理此类案件时，应始终以保护受害未成年人的权益为首要原则。
- 证据的收集与保存至关重要，即使看似微不足道的细节也可能成为关键证据。
- 协商解决与法律途径并非互斥，可根据具体情况灵活选择或结合使用。
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