买房签的补充协议在符合法律规定、双方真实意思表示，且主合同有效的情况下，是合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、补充协议合法性的条件
主体适格：
- 补充协议的签订双方必须具备相应的民事行为能力。购房者需年满18周岁，能够独立进行民事活动；开发商作为企业法人，应具备合法的经营资格和签约能力。若一方不具备合法资格，补充协议可能无效。
主合同有效：
- 补充协议是对购房合同（主合同）的补充和细化，因此必须存在合法有效的主合同。若主合同无效，补充协议亦无效。
意思表示真实：
- 双方在签订补充协议时，必须是真实自愿的，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。如因意思表示不真实而签订，补充协议可能被认定无效。
内容合法明确：
- 补充协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。协议条款应明确、具体，能够确定双方的权利义务，且不违背公序良俗。例如，补充协议中不得约定逃避税收、规避监管等违法内容。
形式符合要求：
- 补充协议应当采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。这是表明双方对协议内容认可的重要方式，使其具有法律效力。
二、可能导致补充协议无效的情形
违反法律法规：
- 如补充协议内容违反限购政策等法律、行政法规的强制性规定，则该补充协议可能无效。
意思表示不真实：
- 如一方以欺诈、胁迫等手段迫使对方签订补充协议，该协议可能因意思表示不真实而被认定为无效。
显失公平：
- 如补充协议内容显失公平，使一方当事人的权益受到重大损害，该协议也可能被认定为无效。
三、补充协议与主合同冲突的处理
- 若补充协议的条款与主购房合同的条款发生冲突，通常以补充协议为准。因为补充协议是对主合同未尽事宜或需要变更的内容进行补充和修正，体现了双方最新的意思表示。
四、签订补充协议的建议
仔细审查条款：
- 在签订补充协议前，双方应仔细审查协议条款，确保其合法、合理、明确。如有必要，可向我咨询专业意见，以确保协议内容符合法律法规和双方的真实意愿。
明确补充内容：
- 补充协议应明确写明需要补充的内容，如房屋交付时间、质量标准、违约责任等，以避免后续可能出现的争议。
签字盖章确认：
- 补充协议经过双方签字或盖章确认后，即具有法律效力。双方应按照补充协议的约定履行各自的义务。
总结来说，买房签的补充协议在符合上述条件的情况下是合法的。双方在签订时应审慎对待，确保协议内容的合法性、明确性，并遵循相关法律法规的规定，以保障自身的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。