针对您提出的一天之内闯了两次红灯的处罚问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、扣分与罚款情况
根据《中华人民共和国道路交通安全法》及其实施条例，以及《道路交通安全违法行为记分分值》的规定，驾驶机动车违反道路交通信号灯通行，即闯红灯，每次将被记6分，并处以20元以上200元以下的罚款。因此，如果您在一天之内闯了两次红灯，那么您将面临累计扣除12分，并累计罚款400元（具体罚款金额可能因地区政策不同而有所差异）的处罚。
二、后续处理流程
记分处理：当您的驾驶证在一个记分周期内累积记分达到12分时，公安机关交通管理部门将扣留您的驾驶证。您需要在15日内到机动车驾驶证核发地或违法行为地公安机关交通管理部门参加为期7日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。学习结束后，您需要参加考试（科目一考试）。考试合格的，记分将予以清除，并发还您的机动车驾驶证；考试不合格的，您需要继续参加学习和考试，直至合格。
罚款缴纳：对于罚款部分，您需要根据交通管理部门开具的处罚决定书，在规定时间内（一般为15日内）到指定银行缴纳罚款。如果您选择非现场处罚（如电子眼抓拍），您可以通过官方网站、手机APP等渠道查询违法记录，并在确认后前往指定地点处理并缴纳罚款。
三、特殊情况与建议
特殊情况：如果您的车辆在红灯时只是刚刚越过停止线但立即停住，且没有明显位置移动，这种闯红灯行为通常不会受到处罚。另外，当信号灯与交警手势发生冲突时，您应服从交警的现场指挥。若因交警现场指挥而闯红灯，您可以到事发地交警大队开具调流证明，免于处罚。
建议措施：为了避免类似的违法行为再次发生，我建议您加强交通安全意识，严格遵守交通规则。您可以通过参加交通安全教育活动、学习交通法规等方式来提高自己的交通安全意识和驾驶技能。同时，在驾驶过程中保持注意力集中，注意观察交通信号灯和交通标志，确保行车安全。
综上所述，一天之内闯两次红灯将面临严重的法律后果，包括扣分、罚款以及可能的驾驶证扣留和考试。因此，我强烈建议您严格遵守交通规则，确保自己和他人的安全。