入住未登记被警察查到，一般情况下不会直接留下案底，但可能会面临一定的法律后果或行政处罚。以下是对这一问题的详细分析：

1. 案底的定义与形成：

   • 案底，通常指的是犯罪记录，即某人因犯罪行为被法院判决有罪后留下的记录。这种记录会保存在公安机关的档案中，对个人的社会信用、就业、出国等方面可能产生长期影响。
   • 入住未登记本身并不构成犯罪行为，因此，单纯因为未登记而被警察查到，并不会直接形成案底。

2. 未登记入住的法律后果：

   • 根据相关法律法规，旅馆业等住宿服务提供者有义务对入住人员进行登记，并核实其身份信息。如果未履行这一义务，可能会面临行政处罚，如罚款、停业整顿等。
   • 对于入住人员而言，如果未主动配合登记，虽然不会直接留下案底，但可能会因违反相关规定而受到警告、罚款等行政处罚。这些处罚记录虽然不属于犯罪记录，但也可能在公安机关的档案中留下痕迹，对个人信用产生一定影响。

3. 特殊情况下的法律后果：

   • 如果未登记入住的行为与更严重的犯罪行为（如逃犯藏匿、恐怖活动等）有关联，那么情况就会变得复杂。在这种情况下，警察可能会进行深入调查，并根据调查结果采取相应的法律措施。
   • 如果因未登记入住而涉及其他犯罪行为，如使用虚假身份证件、逃避公安机关检查等，那么可能会因此面临刑事指控，进而留下案底。

4. 建议与注意事项：

   • 为了避免不必要的麻烦和法律后果，建议入住时主动配合旅馆业等住宿服务提供者的登记要求，提供真实有效的身份信息。
   • 如果因特殊原因无法及时登记或遇到登记问题，应及时与住宿服务提供者沟通并寻求解决方案，避免因此引发不必要的法律纠纷。

总结来说，入住未登记被警察查到本身并不会直接留下案底，但可能会面临行政处罚或与其他犯罪行为相关联的法律后果。因此，建议遵守相关规定，主动配合登记要求，以维护个人信用和避免不必要的法律风险。如果您有任何具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。