长期不在一起生活，确实可以作为起诉离婚的理由之一。在婚姻关系中，夫妻双方因感情不和分居满一定期限，是法律上认定夫妻感情破裂的重要依据，进而可以作为法院判决离婚的条件。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。其中，因感情不和分居满二年，是认定夫妻感情破裂的情形之一。

二、分居的认定

1. 分居的原因：分居必须是因为感情不和，而非因工作、学习等客观原因导致的暂时分离。如果是因为工作、学习等原因导致的分居，即使时间较长，也不符合法律规定的因感情不和分居的情形。
2. 分居的时间：分居的时间必须连续满二年。这里的“二年”是一个固定的时间期限，不是累计计算。同时，分居期间如果双方有短暂的共同生活，可能会影响分居时间的连续性认定。
3. 分居的证明：在起诉离婚时，需要提供证据证明双方因感情不和已经分居满二年。这可以通过租房合同、居住证明、证人证言、通信记录等多种方式来证明。

三、起诉离婚的流程

1. 准备材料：包括起诉状、身份证、结婚证、分居证明等相关证据材料。
2. 提交起诉状：向被告住所地或者经常居住地的人民法院提交起诉状和相关证据材料。
3. 法院受理：法院在收到起诉状后，会进行审查，符合受理条件的，会予以受理并通知双方当事人。
4. 开庭审理：法院会安排开庭时间，对双方当事人进行询问和调解。如果调解无效，法院会根据双方提供的证据和法律规定进行判决。

四、注意事项

1. 分居不是离婚的唯一条件：虽然分居满二年是认定夫妻感情破裂的情形之一，但并不是唯一条件。法院在判决离婚时，还会综合考虑双方的感情基础、婚姻状况、子女抚养等因素。
2. 积极收集证据：在起诉离婚前，应积极收集分居的证据和其他相关证据，以证明夫妻感情已经破裂且无法挽回。
3. 寻求专业帮助：离婚案件涉及法律程序和证据收集等复杂问题，建议寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。

总结来说，长期不在一起生活可以作为起诉离婚的理由之一，但需要满足因感情不和分居满二年的条件，并提供相应的证据证明。如果你面临类似情况，建议积极收集证据并咨询专业律师，以便更好地维护自己的权益。