结论：针对您被包工头骗去做赃款退赃，只退了自己工资而其他款项转给了包工头，现被检察院起诉的情况，您需要积极应对，从是否知情、款项性质、退赃情况等多个角度进行辩护，并考虑聘请专业律师协助处理。
分析说明：
是否知情：
- 如果您在参与过程中并不知情款项为赃款，那么您可能不构成共同犯罪或相关犯罪。在刑事案件中，主观故意是构成犯罪的重要要素之一。如果您能提供证据证明自己确实不知情，比如包工头隐瞒了款项来源，或者您有合理的理由相信款项是合法的，那么这将对您的辩护非常有利。
款项性质：
- 您需要明确自己退还的工资与其他转给包工头的款项在性质上的区别。工资是您应得的劳动报酬，而其他款项如果涉及赃款，则可能涉及不同的法律责任。如果您能证明自己只是退还了应得的工资，而并未参与赃款的分配或转移，那么这有助于减轻您的法律责任。
退赃情况：
- 退赃是刑事案件中考虑量刑的一个重要因素。如果您已经积极退还了自己应退的部分，并且表现出悔罪态度，那么这可能会在量刑时得到一定的考虑。然而，如果您被指控涉及赃款的转移或隐瞒，那么仅仅退还工资可能不足以完全免除您的法律责任。
法律程序与辩护：
- 在面对检察院的起诉时，您有权进行辩护。您可以自己进行辩护，也可以聘请专业律师协助。律师将能够根据您的具体情况，提供专业的法律意见，帮助您制定辩护策略，并在法庭上为您进行辩护。
行动建议：
收集证据：
- 尽快收集所有与案件相关的证据，包括与包工头的沟通记录、工资支付凭证、转账记录等。这些证据将有助于证明您的清白或减轻您的法律责任。
聘请律师：
- 考虑聘请一位在刑事辩护领域有丰富经验的律师。律师将能够为您提供专业的法律意见，帮助您理解案件的法律后果，并制定有效的辩护策略。
积极配合调查：
- 在案件调查过程中，积极配合相关部门的调查工作。如实陈述事实，提供证据，并表现出悔罪态度。这有助于在量刑时得到一定的考虑。
关注案件进展：
- 密切关注案件的进展情况，及时了解检察院的起诉内容和法院的开庭时间。这有助于您及时调整辩护策略，并做好充分的准备。
后续思考：
- 在处理此类案件时，除了法律程序上的应对，还需要考虑如何避免类似情况再次发生。例如，在未来的工作中，加强对工作背景和款项来源的审查，确保自己的行为合法合规。
- 如果案件最终对您产生了不利影响，如被判刑或罚款等，您还需要考虑如何应对这些后果，如申请缓刑、减刑或分期付款等。这需要根据具体情况和法律规定来制定相应的策略。
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