被告在取保候审两年后一直没消息，一般情况下不能直接申请结案，但可以根据具体情况采取相应措施。以下从几个角度为你详细分析：
一、取保候审的期限与案件处理流程
取保候审是刑事诉讼中的一种强制措施，其期限最长不得超过十二个月（对于可能判处有期徒刑以上刑罚，采取取保候审不致发生社会危险性的，期限可以延长至十二个月，但实践中通常理解为单次取保候审最长不超过十二个月，特殊情况需经批准可延长）。在取保候审期间，案件会继续由公安机关、检察院或法院进行侦查、审查起诉或审判。如果取保候审两年后一直没消息，这可能意味着案件仍在处理过程中，或者存在其他特殊情况。
二、不能直接申请结案的原因
案件未终结：取保候审只是强制措施的一种，它并不代表案件已经终结。在取保候审期间，如果案件需要进一步侦查、审查起诉或审判，相关部门会继续进行工作。因此，被告不能仅凭取保候审期限已满就申请结案。
法律程序要求：结案需要满足一定的法律程序要求，如侦查终结、审查起诉完毕、审判结束等。在取保候审期间，如果这些程序尚未完成，案件就不能结案。
三、可以采取的措施
咨询办案机关：被告或其家属可以主动联系办案机关（如公安机关、检察院或法院），了解案件的具体进展情况。如果案件确实已经停滞不前，可以询问原因并寻求解决方案。
申请变更强制措施：如果取保候审期限已满，且案件仍未有进展，被告或其家属可以向办案机关申请变更强制措施，如解除取保候审或转为其他非羁押性强制措施。但需要注意的是，变更强制措施并不等同于结案，它只是改变了对被告的羁押状态。
关注案件动态：被告或其家属应密切关注案件的动态，包括是否收到起诉书、开庭通知等。如果案件进入审判阶段，被告应积极准备应诉，维护自己的合法权益。
寻求法律援助：如果被告对案件处理有疑问或需要法律帮助，可以寻求专业律师的法律援助。律师可以协助被告了解案件进展、准备应诉材料、提供法律咨询等。
四、特殊情况下的处理
如果取保候审两年后一直没消息，且被告认为案件可能存在超期羁押或其他违法行为，可以向相关部门（如检察院的刑事执行检察部门）进行申诉或控告。相关部门会依法进行调查处理，并保障被告的合法权益。
最后需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，因此被告在处理此类问题时应根据自己的实际情况采取相应的措施。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。