结论：工程占用的承包土地是否需要再交地租，需分情况讨论，主要取决于土地占用性质、合同约定以及相关法律法规的规定。以下分情况详细说明：

1. 若工程占用属于临时性占用，且合同中有明确约定
   如果承包合同中明确约定了工程临时占用土地期间的地租支付方式（例如按比例减免、暂停支付或调整支付标准），则应按照合同约定执行。

   • 法律依据：根据《民法典》第五百零九条，当事人应当按照约定全面履行自己的义务。若合同已对临时占用情形作出规定，双方需依约履行。
     
   • 建议：检查承包合同中是否有关于“工程占用”“临时用地”或“地租调整”的条款，优先以合同约定为准。

2. 若工程占用属于永久性占用（如征收、征用）
   若土地因工程建设被永久征收或征用，承包关系通常终止，此时无需继续支付地租，但可能涉及补偿问题：

   • 补偿范围：根据《土地管理法》第四十八条，征收土地应补偿土地补偿费、安置补助费、地上附着物及青苗补偿费等。地租本质是承包费用，征收后土地权属变更，原承包人不再享有土地权益，故无需支付。
     
   • 例外情形：若征收后土地仍由原承包人以其他方式使用（如部分征收后剩余土地继续承包），则需根据剩余土地面积重新协商地租。

3. 若合同未约定且占用性质不明确
   若承包合同未提及工程占用情形，且占用性质（临时或永久）存在争议，需结合以下因素判断：

   • 占用目的与期限：临时占用（如施工堆料）通常期限较短，可协商减免地租；永久占用（如修建基础设施）则涉及征收程序，需依法补偿。
     
   • 实际使用情况：若工程占用导致土地无法正常使用（如完全覆盖、无法耕种），承包人可主张减免或暂停支付地租；若仅部分占用且剩余土地仍可利用，则可能需按比例支付。
     
   • 协商与诉讼：双方可协商补充协议；协商不成时，可通过诉讼或仲裁解决，法院会综合合同目的、公平原则及实际损失裁决。

总结与建议：

• 优先查合同：明确合同中关于工程占用的条款，这是判断地租支付的核心依据。
  
• 区分占用性质：临时占用侧重协商调整，永久占用关注补偿而非地租。
  
• 保留证据：若因占用产生纠纷，需保存土地现状照片、沟通记录、政府征收文件等证据。
  

如有进一步细节（如合同条款、占用性质等），可提供更多信息，我会为您具体分析。