结论：公司规定旷工三天算自动离职并扣全部工资的做法，在大多数情况下是不合法的，你可以通过法律途径维护自己的权益，包括起诉公司。

分析如下：

1. 关于自动离职的合法性：

   • 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的解除应当遵循法定程序和条件。公司单方面规定旷工三天即算自动离职，这种规定本身可能缺乏法律依据，除非该规定在劳动合同或公司规章制度中明确约定，并且该规章制度经过了民主程序制定、公示或告知劳动者，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定。
   • 即便公司有这样的规定，如果旷工行为并未达到严重违反公司规章制度或劳动纪律的程度，公司也不能直接以此为由解除劳动合同而不支付经济补偿或赔偿。

2. 关于扣全部工资的合法性：

   • 根据《劳动法》和《工资支付暂行规定》，劳动者因旷工等违纪行为给用人单位造成损失的，用人单位可以要求劳动者赔偿损失，但赔偿金额应从劳动者工资中扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
   • 公司规定旷工三天就扣全部工资，显然违反了上述规定，属于违法行为。

3. 你的维权途径：

   • 你可以先与公司进行协商，要求公司支付被扣的工资，并解释公司规定的违法性。
   • 如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理。
   • 你还可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付被扣的工资及可能的经济补偿或赔偿。
   • 如果对仲裁结果不服，你还可以向人民法院提起诉讼。

建议：

• 在采取任何行动之前，建议你先收集相关证据，如劳动合同、公司规章制度、工资条、旷工记录等，以证明你的权益受到了侵害。
• 如果你对法律程序不熟悉或担心自己的权益无法得到有效维护，可以寻求专业律师的帮助。

后续行动：

• 如果你决定起诉公司，需要准备起诉状和相关证据材料，并按照法院的要求进行诉讼程序。
• 在诉讼过程中，你需要积极配合法院的工作，如实陈述事实，提供证据，以维护自己的合法权益。

总之，公司规定旷工三天算自动离职并扣全部工资的做法在大多数情况下是不合法的。如果你遇到了这种情况，不要害怕，可以通过法律途径来维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。