竞业协议中公司长期低于30%发放补偿金，并不直接导致协议无效，但协议的有效性及劳动者的权益保障需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：

一、协议有效性的基本判断

1. 合法性原则：竞业协议的有效性首先取决于其是否违反法律法规的强制性规定。如果协议中的补偿金虽然低于劳动者离职前最后一年年工资收入的30%，但并未低于当地最低工资标准或法定最低补偿标准（如有），且协议内容合法，那么该协议在法律上是有效的。

2. 真实意思表示：协议必须是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫、乘人之危等不正当手段。如果劳动者在签订协议时明知补偿金较低但仍自愿接受，且该约定未违反法律法规的强制性规定，那么协议也是有效的。

二、补偿金低于30%的具体影响

1. 显失公平问题：如果补偿金数额过低，导致双方权利义务明显不对等，可能构成显失公平。在此情况下，劳动者有权请求人民法院或仲裁机构变更或撤销该协议，或者要求用人单位补足差额部分。

2. 实际履行情况：用人单位是否按时支付补偿金也是判断协议有效性的重要因素。若用人单位长期未按约定支付补偿金，劳动者有权要求履行或解除协议，并可能因此获得额外的法律救济。

三、劳动者的救济途径

1. 协商调整：劳动者可以尝试与用人单位进行友好协商，说明补偿金过低对自己生活和职业发展的不利影响，争取提高补偿金数额。这是最直接且成本较低的解决方式。

2. 投诉与仲裁：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动保障部门或劳动争议仲裁机构投诉或申请仲裁。在投诉或仲裁过程中，劳动者需要提供相关证据来证明补偿金的合理性问题，以及自己因此受到的不公平待遇。

3. 提起诉讼：若仲裁结果仍不满意，劳动者还可以向人民法院提起诉讼。法院将综合考虑多种因素，如劳动者的工作岗位、工作年限、竞业限制的范围和期限等，来判断补偿金是否合理。如果认定补偿金过低显失公平，法院可能会判决用人单位适当提高补偿金标准。

四、建议与注意事项

1. 明确约定：为避免争议，用人单位与劳动者在签订竞业协议时，应尽可能明确约定补偿金的数额、支付方式及时间等条款。这有助于确保协议的合法性和有效性，并减少后续纠纷的可能性。

2. 合理性评估：用人单位在制定补偿金标准时，应充分考虑劳动者的实际情况和行业标准，确保补偿金数额合理、公正。这有助于维护劳动者的合法权益，并促进用人单位与劳动者之间的和谐关系。

3. 及时咨询：在签订竞业协议前或遇到补偿金问题时，劳动者应及时向我咨询，了解自己的权益和可能的救济途径。我可以根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。

综上所述，竞业协议中公司长期低于30%发放补偿金并不直接导致协议无效，但劳动者有权通过法律途径寻求合理救济。如果你面临此类问题，建议积极采取措施来维护自己的合法权益。