员工可以同时担任母公司和子公司的部门职务，但需满足一定条件并注意潜在的法律风险。以下从不同角度为你详细分析：

一、法律层面：关联企业混同用工的合法性

根据《劳动合同法》及相关司法解释，法律并未禁止员工同时与多个关联企业建立劳动关系，但需满足以下条件：

1. 劳动合同明确性：员工需与母公司或子公司分别签订书面劳动合同，明确各自的权利义务。若未签订合同，可能被认定为事实劳动关系，增加举证难度。
2. 用工管理独立性：母公司和子公司需对员工进行独立的用工管理（如考勤、考核、薪酬发放等）。若管理混同（如统一由母公司安排工作、发放工资），可能被认定为“混同用工”，此时员工可要求所有关联单位共同承担责任（如支付工资、经济补偿等）。
   • 典型案例：某员工同时为母公司和子公司工作，但工资由母公司统一发放，未签订子公司合同。后子公司拖欠工资，法院判决母公司和子公司共同承担支付责任。

二、实务层面：潜在风险与应对建议

1. 竞业限制风险：

   • 若员工在母公司和子公司担任的职务涉及商业秘密或核心技术（如研发、财务、高管等），可能触发竞业限制义务。根据《劳动合同法》第24条，竞业限制仅适用于“高级管理人员、高级技术人员和其他负有保密义务的人员”。
   • 建议：若职务不涉及保密信息，可在劳动合同中明确排除竞业限制条款；若涉及，需与母公司、子公司分别签订竞业限制协议，并约定合理的补偿标准。

2. 社保与税务风险：

   • 员工需在劳动合同签订地缴纳社保和个税。若母公司和子公司位于不同地区，需避免重复缴纳或漏缴。
   • 建议：与母公司、子公司协商确定社保缴纳主体（通常为实际用工单位），并保留工资发放记录、考勤记录等证据，以备税务或社保部门核查。

3. 工作时间冲突风险：

   • 若员工同时为母公司和子公司工作，需确保总工作时间不超过法定标准（如每日8小时、每周40小时）。否则可能构成“非全日制用工”或“加班”，需按法律规定支付加班费。
   • 建议：在劳动合同中明确约定工作时间分配（如“每周为母公司工作3天，为子公司工作2天”），并保留工作安排记录。

三、操作建议：如何合法合规地同时任职

1. 签订两份劳动合同：分别与母公司、子公司签订书面合同，明确职务、工作内容、薪酬结构等。
2. 区分用工管理：确保母公司和子公司对员工进行独立管理（如单独考勤、考核、发放工资）。
3. 书面约定责任分担：若涉及混同用工风险，可与母公司、子公司签订书面协议，约定若发生劳动争议（如拖欠工资、工伤赔偿等），由哪方承担主要责任。
4. 咨询专业律师：若职务涉及高管、核心技术或商业秘密，建议提前规划竞业限制、保密协议等条款，避免后续纠纷。

总结：员工可以同时担任母公司和子公司的部门职务，但需通过书面合同、独立用工管理等方式规避法律风险。若你或你所在的企业面临类似问题，可直接向我咨询具体操作方案。