结论：用人单位克扣退休人员养老金能否申请劳动仲裁，主要取决于退休人员是否享受养老保险待遇或领取退休金，以及其与用人单位之间的实际用工关系。具体来说：
已享受养老保险待遇或领取退休金的退休人员
- 法律关系：根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第三十二条第一款，这类退休人员与用人单位之间发生的用工争议，人民法院应当按劳务关系处理。
- 处理方式：由于劳务关系不属于劳动仲裁的受案范围，因此这类退休人员与用人单位发生纠纷时，不能申请劳动仲裁。他们应当通过民事诉讼途径解决纠纷，比如直接向法院提起诉讼，要求用人单位支付被克扣的养老金。
未享受养老保险待遇或未领取退休金的退休人员
- 特殊情况：对于停薪留职人员、未达到法定退休年龄的内退人员、下岗待岗人员以及企业经营性停产放长假人员等，他们虽然达到退休年龄但未享受养老保险待遇，在与新的用人单位发生用工争议时，人民法院应当按劳动关系处理。
- 处理方式：如果这类人员与用人单位之间的争议符合劳动仲裁的受案范围，他们可以申请劳动仲裁。例如，如果退休人员被新单位聘用后，因加班工资、奖金等问题与单位发生争议，且该争议属于劳动仲裁的受案范围，那么他们可以向劳动仲裁机构申请仲裁。
法律背景与建议：
- 劳务关系与劳动关系的区别：劳务关系是平等主体之间基于民事法律规范产生的权利义务关系，不涉及劳动法上的权利义务，因此不属于劳动仲裁的受案范围。而劳动关系是用人单位与劳动者之间依法建立的权利义务关系，受劳动法调整，发生争议时可以申请劳动仲裁。
- 建议：退休人员在遇到养老金被克扣等问题时，首先应明确自己是否享受养老保险待遇或领取退休金，以及与用人单位之间的实际用工关系。如果属于劳务关系范畴，应通过民事诉讼途径解决；如果属于劳动关系范畴，且争议符合劳动仲裁的受案范围，则可以申请劳动仲裁。
可能的法律后果：
- 如果退休人员错误地选择了处理方式，比如将劳务关系纠纷申请劳动仲裁，可能会被仲裁机构驳回申请，从而浪费时间和精力。
- 如果退休人员选择了正确的处理方式，比如通过民事诉讼或劳动仲裁解决纠纷，并提供了充分的证据支持自己的主张，那么他们有可能获得被克扣的养老金以及相应的法律救济。
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