纪委的款项退还后，通常需要办理以下手续，具体视款项性质和纪委要求而定：

1. 退款确认书
   纪委一般会要求退款人签署《退款确认书》或《自愿退款声明》，明确退款金额、性质（如违纪款、受贿款等）、退款时间及退款方式（现金、转账等）。此文件是纪委内部结案的重要依据，需由退款人签字并按手印确认。

2. 银行转账凭证（如适用）
   若通过银行转账退款，需保留转账回执或电子支付记录，并注明“退款至XX纪委账户”及案件编号（如有）。纪委可能要求核对转账信息与备案账户一致，避免资金流向争议。

3. 收据或结案证明
   部分情况下，纪委会出具《收款收据》或《案件结案证明》，确认款项已入账且案件处理终结。此文件可作为退款人配合调查、免除或减轻责任的凭证，需妥善保管。

4. 个人身份证明复印件
   退款时可能需附上身份证、工作证等复印件，用于核对退款人身份与案件关联性，确保退款主体无误。

5. 其他补充材料
   若款项涉及复杂背景（如多人经手、跨地区案件），纪委可能要求补充退款来源说明、相关交易记录等，以完善证据链。

注意事项：

• 退款前务必与纪委工作人员确认所需材料清单，避免遗漏导致流程延误。
  
• 所有文件建议留存复印件或扫描件，以备后续需要。
  
• 若对退款性质或手续有疑问（如是否涉及税务处理、是否影响个人征信），可直接向我咨询，我会结合具体案情分析法律风险。
  

如有进一步细节需要补充，欢迎随时说明，我会为你提供更精准的建议。