若刑事自诉案件中被告人下落不明，自诉人可采取以下措施，具体需结合案件阶段和法律程序处理：

1. 案件受理阶段：法院可能不予受理或要求补充材料
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，刑事自诉案件需满足“有明确的被告人”这一条件。若被告人下落不明，法院可能以“被告人不明确”为由不予受理，或要求自诉人补充被告人的身份信息、联系方式或下落线索。
   建议：自诉人应尽可能提供被告人的户籍信息、联系方式、最后已知住址等，或通过公告送达、委托调查等方式补充材料，以推动案件受理。

2. 案件审理阶段：法院可采取公告送达或中止审理

   • 公告送达：若被告人下落不明但案件已受理，法院可通过公告方式送达起诉书副本、开庭通知等法律文书。公告期满后，若被告人仍未到庭，法院可缺席审理并作出判决。
     
   • 中止审理：若被告人下落不明导致案件无法继续审理（如需被告人到庭质证、辩护等），法院可裁定中止审理，待被告人出现或下落查明后恢复审理。
     法律依据：《刑事诉讼法》第211条（自诉案件审理程序）、第206条（中止审理情形）。
     建议：自诉人应积极配合法院的公告程序，并关注被告人可能出现的线索，及时向法院提供以推动案件进展。

3. 执行阶段：若被告人被判有罪但下落不明，可申请强制执行或列入失信名单
   若法院已作出有罪判决但被告人下落不明，自诉人可向法院申请强制执行（如罚金、没收财产等）。若被告人拒不履行且下落不明，法院可将其列入失信被执行人名单，限制其高消费、出境等。
   建议：自诉人应保留判决文书及执行申请材料，及时向法院申请执行，并关注被告人的财产线索或行踪，协助法院执行。

4. 特殊情形：被告人可能涉嫌其他犯罪或需通缉
   若被告人下落不明且涉嫌其他犯罪（如故意逃避刑事责任），自诉人可向公安机关报案，请求立案侦查并通缉被告人。若公安机关立案，刑事自诉案件可能转为公诉案件，由检察院提起公诉。
   法律依据：《刑事诉讼法》第110条（立案条件）、第155条（通缉条件）。
   建议：自诉人应收集被告人涉嫌其他犯罪的证据（如暴力、威胁等），及时向公安机关报案并配合调查。

总结：刑事自诉中被告人下落不明时，自诉人需根据案件阶段（受理、审理、执行）采取不同措施，包括补充材料、配合公告送达、申请强制执行或报案通缉等。具体操作需结合案件事实和法律程序，建议自诉人及时咨询专业律师以制定策略。