成立商事调解组织，需根据组织性质和设立层级，向相应部门提出申请，具体如下：

1. 若商事调解组织为民办非企业单位（社会服务机构）
   需向组织所在地的县级以上人民政府民政部门申请登记。根据《民办非企业单位登记管理暂行条例》规定，设立民办非企业单位需满足以下条件：

   • 经业务主管单位审查同意（商事调解组织的业务主管单位通常为司法行政部门或行业主管部门）；
     
   • 有规范的名称、必要的组织机构和章程；
     
   • 有与其业务活动相适应的从业人员和经费来源；
     
   • 有必要的场所和设施。
     申请流程一般为：先向业务主管单位提交申请材料（如可行性报告、章程草案等），经审查同意后，再向民政部门提交登记申请。

2. 若商事调解组织为事业单位性质
   需根据《事业单位登记管理暂行条例》，向县级以上各级人民政府机构编制管理机关申请登记。此类组织通常由政府或相关部门主导设立，需满足事业单位设立的法定条件，如编制、经费来源等，并经上级主管部门批准。

3. 若商事调解组织为企业内部调解机构（非独立法人）
   无需单独申请登记，但需在企业内部制定调解规则，明确调解机构组成、职责和程序，并报企业登记机关或行业主管部门备案（如涉及特定行业）。

关键提示：

• 无论何种性质，商事调解组织均需符合《人民调解法》或《商事调解规则》对调解员资质、调解程序、回避制度等的要求；
  
• 设立前建议先与当地司法行政部门（如司法局）沟通，确认是否需要纳入当地调解组织名录或接受业务指导；
  
• 若涉及跨境商事调解，还需符合国际调解规则或双边协议要求。
  

如有具体设立方案或地区差异问题，可进一步向我咨询。