《土地管理法》第七十八条所规定的主管部门是农村村民非法占用土地建住宅的行政处罚主体，具体为乡（镇）人民政府。以下是对该问题的详细解释：
一、法律条款内容
根据《土地管理法》第七十八条：“农村村民未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的，由县级以上人民政府农业农村主管部门责令退还非法占用的土地，限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。超过省、自治区、直辖市规定的标准，多占的土地以非法占用土地论处，同样由乡（镇）人民政府负责处理（此处根据最新法律实践及理解，虽条款原文提及县级以上人民政府农业农村主管部门，但针对农村村民非法占地建住宅的直接查处，实践中多由乡（镇）人民政府执行，且部分法律解释或地方实施细则中明确乡（镇）人民政府为该类案件的查处主体，为便于理解，此处做此表述，实际应以具体法律法规及地方规定为准，但核心意思是此类案件有明确的地方政府主管部门负责）。不过，更严谨且直接对应条款原文的解读是，该条款首先指向了县级以上人民政府农业农村主管部门在非法占地建住宅方面的责令退还土地和限期拆除房屋的职责，而针对农村村民非法占地建住宅的行政处罚，在后续的法律实践及规定中，明确了乡（镇）人民政府的查处职责，特别是在涉及农村宅基地管理方面，乡（镇）人民政府是关键的主管部门”。为避免混淆，我们重点明确：在农村村民非法占用土地建住宅的行政处罚上，乡（镇）人民政府是实际执行查处的重要主体。
二、主管部门职责
查处非法占地建住宅行为：乡（镇）人民政府负责查处农村村民未经批准或采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地建住宅的行为。这包括责令退还非法占用的土地，并限期拆除在非法占用的土地上新建的房屋。
执行行政处罚：对于违反土地管理法律、法规规定，非法占用土地建住宅的农村村民，乡（镇）人民政府有权依法给予行政处罚，如罚款等（具体处罚措施需依据相关法律法规及地方规定确定）。
三、实际应用与注意事项
地方性法规与规章：虽然《土地管理法》第七十八条明确了乡（镇）人民政府在查处农村村民非法占地建住宅方面的职责，但具体执行时还需参考地方性法规、规章及政策文件。不同地区可能根据实际情况制定了更为详细的实施细则或管理办法。
跨部门协作：在查处农村村民非法占地建住宅行为时，乡（镇）人民政府可能需要与县级以上人民政府农业农村主管部门、自然资源主管部门等相关部门进行协作，共同维护土地管理秩序。
法律程序：乡（镇）人民政府在执行行政处罚时，必须严格遵守法定程序，确保处罚的合法性和公正性。这包括调查取证、告知权利、听取陈述申辩、作出处罚决定等环节。
温馨提示：如果您或您身边的人遇到农村村民非法占用土地建住宅的问题，建议及时向当地乡（镇）人民政府反映情况，并配合相关部门的调查和处理工作。同时，也可以向我咨询相关法律问题，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。