结论：刚转正离职扣两千块是否合理，需根据具体情况判断，包括劳动合同约定、公司规章制度以及离职原因等。以下从不同角度进行分析：
一、劳动合同与规章制度的角度
劳动合同约定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同应当明确约定劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动保护、劳动条件和职业危害防护等事项。若劳动合同中明确规定了离职时需扣除一定金额作为违约金或赔偿金，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则公司扣除两千块可能具有合同依据。
- 但需注意：根据《劳动合同法》第二十五条，除劳动者违反服务期约定或竞业限制约定外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。因此，若公司扣除的款项并非基于上述两种情形，则该约定可能无效。
公司规章制度：
- 公司规章制度若经过民主程序制定，且已向劳动者公示或告知，可以作为管理依据。若规章制度中明确规定了离职时需扣除一定金额作为培训费、服装费等费用，且该规定不违反法律法规的强制性规定，则公司扣除款项可能具有制度依据。
- 但需注意：规章制度的内容必须合法合理，不得侵犯劳动者的合法权益。若规章制度中的扣除条款显失公平或违反法律法规，则该条款可能无效。
二、离职原因与扣除款项合理性的角度
劳动者主动离职：
- 若劳动者主动离职，且未违反劳动合同或公司规章制度中的相关规定，公司一般无权扣除劳动者工资或奖金。若公司扣除两千块作为离职惩罚或未经劳动者同意擅自扣除，则该行为可能违法。
劳动者被迫离职：
- 若劳动者因公司违法行为（如未按时支付劳动报酬、未提供劳动条件等）而被迫离职，公司不仅无权扣除劳动者工资或奖金，还可能需支付经济补偿金。在此情况下，公司扣除两千块显然不合理且违法。
劳动者违反规定离职：
- 若劳动者违反劳动合同或公司规章制度中的相关规定离职（如未提前通知、未办理离职手续等），公司可能根据规定扣除一定金额作为赔偿。但扣除的金额必须合理，且不得超过劳动者实际造成的损失。若公司扣除两千块明显超出合理范围或未经劳动者同意擅自扣除，则该行为可能违法。
三、法律建议与后续行动
核查劳动合同与规章制度：
- 劳动者应仔细核查劳动合同和公司规章制度中关于离职扣除款项的相关规定，确保公司的扣除行为具有合同和制度依据。
与公司协商沟通：
- 若劳动者认为公司扣除款项不合理或违法，可与公司进行协商沟通，要求公司说明扣除款项的依据和理由，并尝试达成和解。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若协商无果，劳动者可向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司返还被扣除的款项并支付可能的赔偿金。若对劳动仲裁结果不满，还可向法院提起诉讼。
总结：刚转正离职扣两千块是否合理，需根据劳动合同约定、公司规章制度以及离职原因等具体情况判断。若劳动者认为公司扣除款项不合理或违法，可与公司协商沟通或申请劳动仲裁、提起诉讼以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。