针对您起诉离婚已经立案但男方仍骚扰您的情况，您可以采取以下措施来保护自己：

1. 保留证据：

   • 首先，务必保留好所有男方骚扰您的证据，包括但不限于短信、电话记录、微信聊天记录、邮件、录音或视频等。这些证据在后续的法律程序中可能会起到关键作用，有助于证明男方的骚扰行为。

2. 向法院申请保护令：

   • 根据《中华人民共和国反家庭暴力法》的相关规定，您可以向法院申请人身安全保护令。保护令可以禁止男方接触您、骚扰您或进行其他威胁您安全的行为。法院在审查后，如果认为存在家庭暴力或骚扰的威胁，会发出保护令，为您提供法律保护。
   • 申请流程：您需要准备一份书面申请，详细描述男方的骚扰行为、您的恐惧和担忧，以及您希望法院采取的保护措施。同时，附上您保留的证据材料。将申请提交给负责您离婚案件的法院，法院会依法进行审查并作出决定。

3. 报警处理：

   • 如果男方的骚扰行为严重到构成治安管理处罚法中的违法行为，如威胁、恐吓、殴打等，您可以立即报警。警方会依法进行调查处理，并根据情况对男方进行警告、罚款或拘留等处罚。
   • 报警流程：拨打110报警电话，向警方详细描述男方的骚扰行为、时间、地点等信息。警方会出警到现场进行调查，并根据情况采取相应的措施。

4. 加强自我保护：

   • 在等待法院和警方处理的同时，您也可以采取一些自我保护措施，如避免单独与男方接触、更换住址或联系方式（如果可能的话）、告知亲友您的处境并寻求他们的帮助和支持等。

5. 继续推进离婚诉讼：

   • 不要因为男方的骚扰行为而中断或放弃离婚诉讼。相反，您应该积极配合法院的工作，提供必要的证据和材料，以推动案件的顺利进行。离婚诉讼的最终目的是解除您与男方的婚姻关系，从而彻底摆脱他的骚扰和威胁。

法律后果提示：

• 如果男方继续骚扰您，且情节严重，可能构成犯罪（如寻衅滋事罪、侮辱罪等），将面临刑事处罚。
• 同时，男方的骚扰行为也可能影响法院在离婚诉讼中对子女抚养权、财产分割等问题的判决。法院在判决时会考虑双方的行为表现和对子女的影响等因素。

建议：

• 在处理此类问题时，保持冷静和理智至关重要。不要因为男方的骚扰行为而做出过激的反应或行为。
• 寻求专业法律帮助也是非常重要的。作为专业律师，我可以为您提供更具体、更个性化的法律建议和帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律支持，请随时向我咨询。