若法院在执行以物抵债过程中未扣除相关税款，您可以通过以下途径解决这一问题：

1. 及时与执行法院沟通
   首先，建议您尽快联系负责执行的法院，向执行法官说明情况，指出在以物抵债过程中未扣除应缴税款的问题。根据《税收征收管理法》第四十五条，税收优先于无担保债权，法院在处置财产时应当依法预留或扣除税款。若法院确实存在疏漏，可通过书面形式提交《执行异议申请书》，要求法院补正执行程序，确保税款优先受偿。

2. 向税务机关申报并补缴税款
   若法院未扣除税款导致您实际承担了额外负担，您可主动向税务机关申报相关税款（如增值税、契税、个人所得税等），并保留完税凭证。随后，您可依据《民事诉讼法》第二百三十二条，以“执行行为违反法律规定”为由，向法院提出书面异议，要求退还您代为缴纳的税款或调整抵债财产的价值。

3. 通过执行复议或监督程序救济
   若法院驳回您的异议申请，您可在收到裁定书之日起10日内向上一级法院申请复议（《民事诉讼法》第二百三十二条）。此外，您还可向检察院申请执行监督（《民事诉讼法》第二百四十二条），由检察院依法对法院的执行活动进行法律监督，纠正违法行为。

注意事项：

• 税款扣除需以法定税种和税率为依据，建议您提前咨询税务机关或专业律师，明确应缴税款的具体金额及计算方式。
  
• 若抵债财产涉及多方债权，税款优先权可能与其他债权产生冲突，需结合具体案情分析权利顺位。
  

建议行动步骤：

1. 整理以物抵债的法院裁定书、税款计算依据等材料；
   
2. 优先通过执行法官沟通解决，若未果则及时提交书面异议；
   
3. 同步咨询税务机关和律师，确保程序合法性与税款计算准确性。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。