结论：伤残鉴定在3个月和6个月时进行，主要区别在于鉴定时机对伤残等级评定的影响，进而可能影响到最终的赔偿金额。具体来说，鉴定时间越晚，若伤情稳定且未出现恶化，则伤残等级可能相对较低，赔偿金额也可能相应减少；反之，若伤情在恢复过程中出现恶化或并发症，鉴定时间较晚可能更有利于准确反映伤残程度，从而可能获得更高的赔偿。但总体而言，赔偿金额的差异并非仅由鉴定时间决定，还受到伤残等级、赔偿标准等多种因素的影响。
详细分析：
鉴定时机对伤残等级的影响：
- 早期鉴定：在受伤后3个月进行伤残鉴定，此时伤情可能尚未完全稳定，特别是对于一些需要长期恢复或可能留下后遗症的伤情。如果此时进行鉴定，可能会因为伤情未完全稳定而评出较高的伤残等级，但这也存在风险，即如果后续伤情好转，实际伤残程度可能低于鉴定等级。
- 晚期鉴定：在受伤后6个月或更长时间进行伤残鉴定，此时伤情通常已经相对稳定，鉴定结果更能准确反映实际的伤残程度。如果伤情在恢复过程中没有出现恶化或并发症，那么伤残等级可能会相对较低。
伤残等级对赔偿金额的影响：
- 伤残等级是确定赔偿金额的重要因素之一。一般来说，伤残等级越高，赔偿金额也越高。因此，鉴定时间的选择可能会间接影响到赔偿金额。
- 赔偿金额的计算通常基于伤残等级、当地赔偿标准以及受害者的具体情况（如年龄、收入等）进行综合计算。因此，即使鉴定时间不同导致伤残等级有所差异，最终的赔偿金额也会因其他因素的综合作用而有所不同。
其他影响因素：
- 除了鉴定时间和伤残等级外，赔偿金额还受到当地经济发展水平、赔偿标准、受害者家庭情况等多种因素的影响。
- 在某些情况下，即使鉴定时间较晚，如果受害者能够提供充分的证据证明其伤残程度与早期鉴定时相比并未减轻，或者甚至有所加重，那么仍然有可能获得较高的赔偿。
法律建议：
- 及时咨询专业律师：在面临伤残鉴定和赔偿问题时，建议及时咨询专业律师，了解当地的具体法律规定和赔偿标准，以便更好地维护自己的合法权益。
- 关注伤情稳定情况：在选择鉴定时间时，应充分考虑伤情的稳定情况。如果伤情尚未稳定，建议等待一段时间再进行鉴定，以确保鉴定结果的准确性。
- 保留相关证据：在受伤后，应妥善保留与伤情相关的所有证据，包括医疗记录、诊断证明、费用单据等。这些证据在后续的伤残鉴定和赔偿过程中将起到至关重要的作用。
示例说明：
假设某受害者在工作中受伤，初步诊断为骨折并可能留下后遗症。在受伤后3个月时，受害者选择进行伤残鉴定，此时伤情尚未完全稳定，鉴定结果为九级伤残。然而，在后续的治疗过程中，受害者的伤情并未出现恶化或并发症，且逐渐好转。如果此时按照九级伤残的标准进行赔偿，可能会相对较高。但如果受害者在受伤后6个月或更长时间再进行鉴定，此时伤情已经稳定，且未出现恶化或并发症，鉴定结果可能降为十级伤残，赔偿金额也会相应减少。但具体赔偿金额还需根据当地赔偿标准和其他因素进行综合计算。