补充合同和主合同均具有法律效力，但二者的法律效力关系及具体应用需视情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、法律效力关系
主合同是基础：主合同是双方当事人之间设立、变更、终止民事权利义务关系的基本协议，它规定了合同的主要条款和双方的主要权利义务。主合同一旦成立并生效，即对双方当事人产生法律约束力。
补充合同是补充：补充合同是对主合同中未约定或约定不明确的事项进行补充、修改或完善的协议。它通常是在主合同签订后，因实际情况变化或双方协商一致而签订的。补充合同的内容应当与主合同的内容相互衔接、相互补充，共同构成完整的合同关系。
法律效力相互关联：补充合同与主合同具有同等的法律效力，但二者在法律效力上并非完全独立。补充合同的内容通常受到主合同的限制和约束，不得与主合同的内容相抵触。同时，补充合同也可以对主合同的内容进行修改或补充，但这种修改或补充应当是在双方协商一致的基础上进行的。
二、具体应用情况
补充合同内容与主合同一致：如果补充合同的内容与主合同的内容完全一致，或者只是对主合同中的某些条款进行了进一步的明确或细化，那么补充合同与主合同在法律效力上是等同的。在这种情况下，双方当事人应当按照补充合同和主合同的约定共同履行合同义务。
补充合同内容与主合同不一致：如果补充合同的内容与主合同的内容存在不一致之处，那么需要根据具体情况来判断哪个合同的内容应当优先适用。一般来说，如果补充合同是在主合同签订后签订的，且双方当事人在补充合同中明确约定了以补充合同为准或者对主合同的某些条款进行了修改或补充，那么应当以补充合同的内容为准。但是，如果补充合同的内容违反了法律、行政法规的强制性规定或者损害了社会公共利益，那么该部分内容将被视为无效，不影响主合同其他部分的效力。
补充合同未涉及主合同部分条款：如果补充合同仅对主合同中的部分条款进行了补充或修改，而未涉及主合同的其他条款，那么主合同中未涉及的部分仍然有效，双方当事人应当继续按照主合同的约定履行相关义务。
三、法律建议
签订补充合同前仔细审查主合同：在签订补充合同前，双方当事人应当仔细审查主合同的内容，确保补充合同的内容与主合同的内容相互衔接、相互补充，避免出现矛盾或冲突。
明确补充合同的效力范围：在补充合同中，双方当事人应当明确约定补充合同的效力范围，包括哪些条款是对主合同的补充或修改，哪些条款是新增的内容等。这有助于避免在履行合同过程中出现争议或纠纷。
及时办理相关手续：如果补充合同的内容涉及到需要办理相关手续或批准的事项（如变更登记、备案等），双方当事人应当及时办理相关手续或批准程序，确保补充合同的法律效力得到认可和保护。
总结来说，补充合同和主合同均具有法律效力，但二者的法律效力关系及具体应用需根据具体情况来判断。在签订和履行合同过程中，双方当事人应当谨慎对待补充合同的签订和履行问题，确保合同的合法性和有效性。如果您在合同纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。