农业银行信用卡逾期后，一般没有只还本金这一固定政策，但具体能否协商只还本金，需结合实际情况判断，以下是详细分析：

1. 银行常规处理方式
   信用卡逾期后，银行通常会按照合同约定要求持卡人偿还本金、利息、违约金等全部费用。利息一般按日利率万分之五计算，违约金为最低还款额未还部分的5%。这是银行基于合同条款和行业惯例的常规操作，目的是保障资金安全和合规运营。

2. 协商还款的可能性
   若持卡人因特殊原因（如重大疾病、失业等）导致还款困难，可主动联系银行协商还款方案。银行可能根据持卡人的还款能力、逾期时间、信用记录等因素，酌情减免部分利息或违约金，甚至允许分期偿还本金。但“只还本金”通常需要持卡人提供充分证明材料，且银行最终是否同意存在不确定性。

3. 法律层面的规定
   根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》第七十条，在特殊情况下，确认信用卡欠款金额超出持卡人还款能力、且持卡人仍有还款意愿的，发卡银行可以与持卡人平等协商，达成个性化分期还款协议。但法律并未规定银行必须减免利息或只收本金，具体协商结果取决于双方沟通情况。

4. 实践中的建议

   • 主动沟通：逾期后第一时间联系银行客服，说明困难原因，表达还款意愿。
     
   • 提供证明：如失业证明、医疗证明等，增强协商说服力。
     
   • 保留证据：协商过程中注意录音或留存书面记录，避免后续纠纷。
     
   • 谨慎委托：若委托第三方协商，需核实对方资质，防止被骗。

总结：农业银行信用卡逾期后，银行通常不会主动允许只还本金，但持卡人可通过协商争取减免部分费用。若协商无果，建议优先偿还最低还款额或申请分期，避免逾期记录进一步恶化信用。如有具体案例或需要进一步分析，可直接向我咨询。