农村土地经营权再流转时，约定政策性补贴归流出方是否有效，需根据具体情况判断，但通常在符合法律规定且不损害他人利益的情况下，该约定是有效的。以下从不同角度进行分析：
一、法律背景与原则
农村土地经营权流转的法律规定：
- 根据《中华人民共和国农村土地承包法》等相关法律法规，农村土地经营权可以依法流转。流转时，双方可以约定流转的方式、期限、价款以及双方的权利义务等。
政策性补贴的性质：
- 政策性补贴通常是政府为了鼓励或支持特定农业活动而给予的财政补助。这些补贴的归属，往往取决于补贴政策的具体规定以及土地经营权流转合同的约定。
二、约定政策性补贴归流出方的有效性分析
合同自由原则：
- 在民事法律关系中，合同自由原则是一项基本原则。只要双方当事人在平等、自愿、公平、诚实信用的基础上签订合同，且合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么合同就是有效的。
- 因此，如果农村土地经营权流转合同中明确约定了政策性补贴归流出方所有，且该约定不违反相关法律法规和政策规定，那么该约定就是有效的。
补贴政策的考量：
- 然而，也需要注意补贴政策的具体规定。有些补贴政策可能明确规定了补贴的归属，如直接补贴给实际耕种者或土地经营者。在这种情况下，如果流转合同中的约定与补贴政策相冲突，那么该约定可能因违反政策规定而无效或部分无效。
- 因此，在签订流转合同时，双方应充分了解并考虑补贴政策的具体规定，以确保合同约定的合法性和有效性。
不损害他人利益的原则：
- 此外，流转合同的约定还应遵循不损害他人利益的原则。如果约定政策性补贴归流出方所有，但这一约定损害了实际耕种者或土地经营者的合法权益，那么该约定可能因违反公平原则而无效或被撤销。
三、法律建议
明确约定：
- 在签订农村土地经营权流转合同时，双方应明确约定政策性补贴的归属。如果约定归流出方所有，应确保该约定不违反相关法律法规和政策规定，且不损害实际耕种者或土地经营者的合法权益。
了解政策：
- 在签订合同前，双方应充分了解并考虑补贴政策的具体规定。如果可能的话，可以咨询当地农业部门或相关机构以获取更准确的政策信息。
寻求法律帮助：
- 如果对流转合同的约定或补贴政策的归属存在疑问或争议，建议寻求专业律师的法律帮助。律师可以根据具体情况提供法律意见和解决方案，以维护双方的合法权益。
总结来说，农村土地经营权再流转时约定政策性补贴归流出方是否有效，需根据合同约定、补贴政策以及不损害他人利益的原则进行综合判断。在签订合同时，双方应明确约定并充分了解相关政策规定，以确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或争议，建议直接向我咨询。