帮助商家减少税款的行为是否违法以及如何处罚，需分情况讨论：

1. 若通过合法税务筹划减少税款
   若商家通过合法手段（如利用税收优惠政策、合理成本扣除、转移定价等）进行税务筹划，且符合税法规定，则不违法。例如，企业依法申请高新技术企业资质享受15%的企业所得税优惠税率，或通过研发费用加计扣除减少应纳税所得额，均属于合法行为。

2. 若通过违法手段减少税款
   若通过虚假申报、隐匿收入、虚开发票、伪造账簿等手段逃避纳税义务，则构成偷税行为，违反《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条。具体处罚如下：

   • 追缴税款：税务机关将追缴商家少缴的税款；
     
   • 滞纳金：从税款滞纳之日起，按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金；
     
   • 罚款：处少缴税款50%以上5倍以下的罚款；
     
   • 刑事责任：若偷税数额较大且占应纳税额10%以上，可能构成逃税罪，依据《中华人民共和国刑法》第二百零一条，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大且占应纳税额30%以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

3. 若协助商家实施违法避税
   若个人或机构通过设计虚假交易、帮助虚开发票等方式协助商家偷税，同样构成违法。根据《税收征收管理法实施细则》第九十三条，税务代理人违反规定造成纳税人未缴或少缴税款的，由税务代理人补缴应纳税款、滞纳金，并处相应罚款；若构成犯罪，依法追究刑事责任。

建议：

• 商家应严格遵守税法规定，通过合法途径优化税务成本；
  
• 若对税务筹划有疑问，可直接向我咨询，我将结合具体业务场景提供合规建议；
  
• 若发现商家存在偷税行为，应及时纠正并补缴税款，避免刑事风险升级。