滞纳金通常是按照未还款金额来收取的，而非本金。以下从不同角度为你详细分析：

法律角度

在合同纠纷中，滞纳金一般被视为违约方因未履行或未完全履行合同义务而应支付给守约方的一种违约金或赔偿金。其计算基础通常是违约方未履行的部分，即未还款金额，而非合同的本金总额。这是因为，违约金的目的是为了补偿守约方因违约行为所遭受的损失，而损失的大小通常与违约部分直接相关。例如，在一份借款合同中，如果借款人未按时偿还部分借款，那么滞纳金就应当基于这部分未偿还的借款来计算，而非整个借款本金。

合同约定角度

具体滞纳金的计算方式还需依据合同中的约定。合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。如果合同中明确规定了滞纳金是按照未还款金额来计算的，那么双方就应当按照这一约定来执行。反之，如果合同中没有明确规定或者规定不明确，那么就需要根据法律的相关规定和交易习惯来推断。在大多数情况下，为了公平合理，滞纳金都是按照未还款金额来计算的。

实际操作角度

在实际操作中，如果滞纳金是按照本金来收取的，那么对于违约方来说可能过于苛刻，尤其是当违约部分只占本金很小比例时。而按照未还款金额来收取滞纳金，则更能体现违约金的补偿性质，也更符合公平合理的原则。例如，在一份购物合同中，如果消费者只未支付一小部分货款，而商家却要求按照整个货款本金来收取滞纳金，这显然对消费者是不公平的。

建议：

1. 仔细审查合同：在签订合同时，务必仔细审查合同中关于滞纳金的条款，确保自己清楚了解滞纳金的计算方式和支付条件。
2. 及时沟通协商：如果因故无法按时履行合同义务，应及时与对方沟通协商，寻求延期履行或分期履行的可能性，以避免或减少滞纳金的支付。
3. 寻求法律帮助：如果因滞纳金问题产生纠纷，且无法通过协商解决，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径来维护自己的合法权益。

如果你在合同纠纷中遇到了滞纳金相关的问题，或者有任何其他法律疑问，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业、全面的法律解答。