当车主的驾照已经扣了6分，之后别人驾驶你的车辆又扣了6分时，处理这种情况需要分步骤进行，同时要考虑驾驶证类型、记分周期以及法律责任等多个方面。以下是一个详细的处理流程：
一、确认违章信息与责任归属
查询违章详情：
- 首先，你需要通过交通管理部门的官方网站、手机APP（如交管12123）或亲自前往车管所、交警大队等渠道，查询具体的违章信息。这包括违章时间、地点、行为等，确保信息的准确性。
与驾驶人沟通：
- 与驾驶你车辆的朋友或家人进行坦诚交流，明确告知其违章情况，并了解具体违章原因。
- 确认是对方在驾驶过程中导致的违章后，双方应协商如何处理后续的扣分和罚款问题。
二、处理违章的具体方法
线下处理：
- 如果选择线下处理，你需要携带驾驶人的驾驶证、你的行驶证以及驾驶人的身份证原件，前往当地交警大队的违章处理窗口。
- 在窗口工作人员的指导下，调出违章记录，由驾驶人确认违章信息后进行扣分处理，并出具违章处罚决定书。
- 根据处罚决定书到指定银行缴纳罚款。
线上处理：
- 驾驶人需在交管12123APP上注册并绑定你的车辆。
- 登录APP后，点击“违法处理”，选择需要处理的违章记录，按照系统提示完成扣分和缴纳罚款的操作。
三、根据驾驶证类型分类处理后续事宜
C类驾驶证：
- 如果驾驶人的C类驾驶证在记分周期内扣分不满12分，缴纳罚款后，扣分记录会在记分周期结束时自动清除。
- 驾驶人还可以通过“学法减分”活动减免记分，最多可减免6分，以减轻扣分压力。
A、B类驾驶证：
- 如果驾驶人的A、B类驾驶证在记分周期内有记分但未达12分，除了缴纳罚款外，还需在每个记分周期结束后三十日内到公安机关交通管理部门接受审验，参加相关学习并接受交通事故案例警示教育。
- 如果记分周期内记满12分，车辆管理所将注销其最高准驾车型驾驶资格，驾驶人需在规定时间内办理降级换证业务，并参加学习通过科目一考试。
四、特别提醒与预防措施
关注记分周期：
- 驾照的记分周期通常为一年（从初次领证日期开始计算）。在一个记分周期内，扣分累计未达到12分且罚款已全部缴清，下一个记分周期开始时扣分会自动清零。
- 你需要密切关注自己和驾驶人的记分周期，避免扣分累积过多导致严重后果。
加强沟通与约定：
- 在借车前与驾驶人明确约定相关责任和义务，如违章处理方式、费用承担等，以减少后续纠纷。
- 考虑在车辆上安装行车记录仪等设备，以记录行车过程，为可能出现的争议提供证据支持。
法律咨询：
- 如果对处理流程或法律责任有任何疑问或不确定的地方，应及时咨询专业的律师或交警部门的工作人员，以获取准确的指导和帮助。
综上所述，当车主的驾照已经扣了6分，之后别人驾驶你的车辆又扣了6分时，你需要通过确认违章信息、与驾驶人沟通协商、妥善处理违章事宜，并考虑法律后果和采取预防措施来有效解决问题并减少潜在风险。同时，加强交通安全意识，确保自己和他人的安全是至关重要的。