法人股权代持协议在符合法律法规的前提下，是受到法律保护的。以下是对此问题的详细解析：
一、股权代持协议的合法性及法律依据
意思自治与合同效力：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，只要股权代持协议是双方真实意思表示，代持双方具有相应的民事行为能力，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该代持协议即为有效，对双方具有法律约束力。这意味着，如果法人作为实际出资人与名义股东签订的股权代持协议满足上述条件，那么该协议是受到法律保护的。
委托合同关系：
- 股权代持关系可视为一种委托关系，适用《民法典》中关于委托合同的规定。实际出资人（法人）相当于委托人，名义股东相当于受托人，名义股东受实际出资人的委托，以自己的名义代实际出资人持有股权并处理相关事务。这种委托关系在法律上是受到保护的。
股权代持协议的效力认定：
- 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（三）》明确规定，有限责任公司的实际出资人与名义出资人订立的股权代持协议，如无法律规定的无效情形，人民法院应当认定该合同有效。这进一步确认了股权代持协议的合法性，包括法人作为实际出资人的情况。
二、实际出资人（法人）的权益保护
投资权益的归属：
- 实际出资人（法人）虽然未登记为公司股东，但只要能证明自己实际履行了出资义务，就有权向名义股东主张投资权益。这意味着，如果法人通过股权代持协议进行了投资，并履行了出资义务，那么其投资权益是受到法律保护的。
名义股东的责任：
- 如果名义股东将登记于其名下的股权转让、质押或以其他方式处分，实际出资人（法人）可以请求人民法院认定处分股权行为无效。法院在处理时会考虑受让人是否为善意等因素来判断股权转让等行为的效力。这保护了实际出资人（法人）的股权不被名义股东擅自处分。
三、实际出资人（法人）的显名化
- 实际出资人（法人）想要显名成为公司正式股东，需要经过公司其他股东半数以上同意。未经此程序，请求公司变更股东、签发出资证明书、记载于股东名册、记载于公司章程并办理公司登记机关登记的，人民法院不予支持。这是实际出资人（法人）在股权代持中需要注意的一点，即显名化需要满足一定的条件。
四、法律风险与防范
尽管股权代持在法律上是受到保护的，但在实际操作中仍存在一些法律风险，如名义股东的道德风险、债权人的追索等。因此，我建议：
- 在签订股权代持协议前，务必确保协议内容合法合规，明确双方的权利和义务。
- 对名义股东进行充分调查，了解其信誉和财务状况，以降低潜在风险。
- 考虑设置必要的监督机制，以确保名义股东按照协议行事。
综上所述，法人股权代持协议在符合法律法规的前提下是受到法律保护的。然而，由于股权代持涉及复杂的法律关系和潜在风险，建议在实际操作中谨慎对待，并采取有效措施降低风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。