结论：派出所所长在铐了双手后又用拳头打头部，这一行为是违法的，可能涉及滥用职权和故意伤害等违法行为。
详细分析：
关于手铐的使用：
- 手铐作为警械，其使用必须严格遵循法律规定。根据《中华人民共和国人民警察使用警械和武器条例》的相关规定，人民警察在依法执行职务时，遇有违法犯罪分子可能脱逃、行凶、自杀、自伤或者有其他危险行为的，可以使用手铐等约束性警械。但使用警械必须遵循必要性、适度性和合法性的原则，不得滥用。
- 如果所长在没有合法依据或超出必要限度的情况下使用手铐，就可能构成滥用职权或非法拘禁等违法行为。不过，仅从“铐了双手”这一描述，我们无法直接判断其是否违法，因为这取决于具体情境和必要性。但结合后续行为，这一行为的合法性将受到质疑。
关于用拳头打头部的行为：
- 无论所长是否合法地使用了手铐，用拳头打头部都是明显的暴力行为，且很可能构成故意伤害。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，故意伤害他人身体的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制。如果造成严重后果，如重伤或死亡，处罚将更为严厉。
- 此外，作为公职人员，所长还可能面临行政纪律处分或职务违法犯罪的追究。公职人员的行为不仅受刑法约束，还受《中华人民共和国公职人员政务处分法》等法规的规范。
综合判断：
- 结合上述两点，所长在铐了双手后又用拳头打头部的行为，显然超出了合法执法的范畴，构成了违法行为。这一行为不仅侵犯了公民的人身权利，也损害了公安机关的形象和公信力。
法律建议：
- 对于受害者：如果遭受了此类暴力行为，应立即向当地公安机关的上级部门或纪检监察机关报案，要求依法处理。同时，可以保留相关证据，如医疗记录、现场照片或视频等，以便后续维权。
- 对于公安机关：应加强对执法人员的培训和管理，确保执法行为合法、规范、文明。对于违法执法行为，应依法严肃处理，以维护法律的尊严和公民的合法权益。
可能的法律后果：
- 对于所长：可能面临刑事指控（如故意伤害罪）和行政纪律处分（如开除公职、降级等）。具体后果将取决于行为的严重程度、造成的后果以及相关法律法规的规定。
- 对于公安机关：可能因管理不善或执法不当而承担相应的法律责任，如赔偿受害者损失、接受上级机关的批评或处分等。
总之，派出所所长在铐了双手后又用拳头打头部的行为是违法的，应依法受到严肃处理。如果你或他人遭遇了类似情况，请及时向我咨询，我将为你提供专业的法律帮助。