税收机关在申请人已申请行政复议期间，一般不能就同一件事追加处罚，但存在例外情形。具体分析如下：

1. 一般原则：一事不再罚与行政复议的效力
   根据《行政处罚法》第二十九条及行政法“一事不再罚”原则，对同一违法行为，行政机关不得以同一事实和理由重复处罚。若税收机关已作出处罚决定，申请人申请行政复议后，复议机关尚未作出最终裁决前，原处罚机关原则上不得自行追加处罚。这是因为行政复议期间，原行政行为的效力处于“待定”状态，需等待复议结果确认其合法性。若允许追加处罚，可能破坏行政程序的稳定性，损害申请人救济权。

2. 例外情形：新事实或证据的出现
   若在行政复议期间，税收机关发现申请人存在新的违法行为（如漏报其他税种、提供虚假材料等），或原处罚决定遗漏了部分违法事实，且新事实与原处罚事项非同一法律关系，则可依法追加处罚。例如：

   • 原处罚针对的是“未申报增值税”，复议期间发现申请人同时存在“虚开发票”行为，两者分属不同税种和违法性质，可追加处罚；
     
   • 若原处罚仅针对“2023年1月未申报”，复议期间发现申请人“2023年2月也未申报”，因时间不同属于新事实，可追加处罚。
     关键点：新处罚需基于独立的事实和法律依据，且与原处罚无直接关联。

3. 程序要求：追加处罚的合法性审查
   即使存在新事实，税收机关追加处罚仍需严格遵循法定程序：

   • 告知权利：需向申请人送达《税务行政处罚事项告知书》，说明追加处罚的事实、理由及依据，并告知陈述、申辩权；
     
   • 听证权利：若追加处罚达到听证标准（如罚款金额较大），应保障申请人听证权；
     
   • 复议衔接：申请人对追加处罚不服的，可一并申请行政复议，复议机关将合并审查原处罚与追加处罚的合法性。

4. 实务建议：申请人的应对策略

   • 核对事实：若收到追加处罚通知，首先核对新事实是否真实存在，是否与原处罚重复；
     
   • 程序维权：若认为追加处罚违法（如无新事实、未履行告知程序等），可在复议中一并主张撤销；
     
   • 证据固定：及时收集与原处罚、追加处罚相关的证据（如申报记录、沟通材料等），以支持复议或诉讼主张。

总结：行政复议期间，税收机关原则上不得就同一事项追加处罚，但若发现新违法行为或遗漏事实，且符合独立处罚条件，可依法追加。申请人需重点关注追加处罚的事实依据和程序合法性，必要时通过复议或诉讼维护权益。如有具体案件，可进一步提供细节，我会为您分析应对方案。