盖水井的补偿计算需根据具体场景和法律关系确定，主要分为以下几种情况：

1. 因公共利益（如市政建设、水利改造）需要占用或拆除私人水井
   根据《民法典》第243条，征收私有财产应给予“公平、合理”的补偿，补偿范围包括：

   • 直接损失：水井的建设成本（材料、人工、设备等）、现有价值（如使用年限折旧后的残值）；
     
   • 间接损失：若水井是生产生活必需设施（如农业灌溉、家庭用水），需补偿因水井拆除导致的替代方案成本（如打新井费用、购买水资源的费用）；
     
   • 协商或评估程序：补偿标准通常由征收方与权利人协商确定，协商不成可委托第三方评估机构评估，或通过行政复议、诉讼解决争议。

2. 因相邻权纠纷（如邻居建房影响水井使用）
   根据《民法典》第288-296条，相邻方应避免对他人合法权益造成妨碍。若水井因邻居行为受损（如堵塞、污染），补偿计算需考虑：

   • 修复费用：恢复水井原状所需的材料、人工成本；
     
   • 功能损失：若水井无法修复，需补偿其原有功能对应的价值（如替代水源费用）；
     
   • 举证责任：受损方需证明损害与邻居行为存在因果关系，可通过鉴定报告、现场照片等证据支持主张。

3. 因侵权行为（如他人故意破坏水井）
   根据《民法典》第1165、1184条，侵权人需赔偿实际损失，计算方式包括：

   • 直接损失：水井的修复或重建费用；
     
   • 间接损失：若水井用于经营（如养殖、灌溉），需赔偿因停用导致的利润损失（需提供收入证明、合同等证据）；
     
   • 惩罚性赔偿：若侵权行为恶劣（如恶意破坏），法院可能酌情支持额外赔偿。

建议行动步骤：

1. 明确补偿场景（公共征收、相邻纠纷、侵权）；
   
2. 收集证据（水井建设合同、评估报告、损失证明等）；
   
3. 优先协商，协商不成可申请行政调解或提起民事诉讼；
   
4. 若涉及公共利益，可要求征收方公示补偿方案依据。
   

如有具体场景或证据材料，可进一步向我说明，我会结合细节分析补偿方案。