工程合同纠纷案申请再审是需要缴纳诉讼费的，但具体费用情况需根据案件性质和再审请求来确定。以下是对这一问题的详细分析：
再审案件受理费的缴纳原则：
- 根据《诉讼费用交纳办法》的相关规定，当事人申请再审，需要按照规定交纳案件受理费。但这里有一个特殊情况，即如果当事人对第一审人民法院不予受理、驳回起诉的裁定提起上诉，第二审人民法院维持第一审人民法院作出的裁定的，第一审人民法院不收取案件受理费，第二审人民法院也不收取案件受理费。不过，在工程合同纠纷案中，这种情况较为少见，通常再审申请会涉及对原判决、裁定的实质性审查，因此需要缴纳案件受理费。
再审案件受理费的计算标准：
- 再审案件受理费的计算标准与一审、二审案件受理费的计算标准相同，即根据诉讼请求的金额或者价额，按照比例分段累计交纳。具体标准如下（以财产案件为例）：
| 争议金额范围 |
收费标准 |
| 不超过1万元 |
每件交纳50元 |
| 超过1万元至10万元 |
超过部分×2.5%－200元 |
| 超过10万元至20万元 |
超过部分×2%+300元 |
| ...（以此类推） |
... |
- 举例说明：若工程合同纠纷案的原判决金额为100万元，当事人申请再审时，若再审请求涉及该全部金额，则案件受理费大致为（具体计算可能因地区和法院规定略有差异）：\(10000\times0.025-200+900000\times0.01+3800=14550\)元（此计算仅为示例，实际费用需根据法院具体规定确定）。
其他可能涉及的诉讼费用：
- 除了案件受理费外，再审过程中还可能涉及其他诉讼费用，如申请费（如申请执行费、保全费等）、鉴定费、公告费、翻译费等。这些费用的具体金额和承担方式需根据案件实际情况和法院规定来确定。
费用减免与缓交：
- 如果当事人经济困难且符合法定条件，可以向法院申请减免诉讼费用。同时，符合缓交条件的当事人也可以在立案时提出书面申请，经法院审查同意后暂缓交纳诉讼费用。
建议：
- 在申请再审前，建议当事人先咨询专业律师，对案件进行全面评估，确定再审请求和诉讼策略，以便更准确地估算诉讼费用。
- 当事人应按照法院通知要求在规定时间内完成缴费，避免影响案件受理进度。同时，保留好缴费凭证作为后续报销或证明依据。
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