结论：公务员在职期间注册公司，单位负责人是否有责任，需根据具体情况判断，主要看单位负责人是否知情、是否参与管理以及是否违反相关法律法规。

分析：

1. 公务员在职期间注册公司的合法性：

   • 根据《中华人民共和国公务员法》的相关规定，公务员应当遵纪守法，不得从事或者参与营利性活动，在企业或者其他营利性组织中兼任职务。这意味着，公务员在职期间注册公司，本身可能就违反了公务员法的规定。

2. 单位负责人的责任：

   • 如果单位负责人不知情：如果公务员在职期间注册公司，且单位负责人对此并不知情，那么单位负责人通常不需要承担直接责任。因为责任的前提是知情并可能参与或默许了该行为。
   • 如果单位负责人知情并参与管理：如果单位负责人知道公务员在职期间注册公司，并且参与了公司的管理或从中获利，那么单位负责人可能构成共同违法或犯罪，需要承担相应的法律责任。这包括但不限于行政责任、民事责任，甚至刑事责任，具体取决于行为的性质和后果。
   • 如果单位负责人未履行监管职责：即使单位负责人没有直接参与公司的管理，但如果其作为单位负责人，有义务对下属的行为进行监管，而未能履行这一职责，导致公务员在职期间注册公司并可能造成不良后果的，单位负责人也可能因失职而承担一定的责任。

3. 可能的法律后果：

   • 对于公务员本人，如果违反公务员法规定从事营利性活动，可能会受到警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等行政处分。
   • 对于单位负责人，如果构成共同违法或犯罪，或者因失职而承担责任，也可能面临相应的行政处分、民事赔偿或刑事处罚。

建议：

• 对于公务员而言，应严格遵守公务员法的规定，不得从事或参与营利性活动，以免给自己和单位带来不必要的法律风险。
• 对于单位负责人而言，应加强对下属的监管，确保下属不违反法律法规和单位规章制度。如果发现下属有违法违规行为，应及时制止并报告相关部门。
• 如果遇到相关法律问题或疑虑，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。