农村建筑合法性的认定主要依据是否符合相关法律法规及规划要求，核心在于满足土地使用、规划许可、施工许可等法定条件。具体可从以下几个角度分析：

1. 土地使用合法性
   农村建筑必须建在合法取得的宅基地或集体建设用地上。根据《土地管理法》，宅基地需经乡镇政府审核、县级政府批准，且符合“一户一宅”原则（即一户只能拥有一处宅基地，面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准）。若占用农用地（如耕地），需依法办理农用地转用审批手续，否则可能构成非法占地。

2. 规划许可合规性
   建筑需符合乡村规划要求。根据《城乡规划法》，在乡、村庄规划区内进行乡镇企业、乡村公共设施和公益事业建设，以及农村村民住宅建设，需取得乡村建设规划许可证。未取得该许可证擅自建设的，可能被认定为违法建筑。

3. 施工许可与安全标准
   若建筑层数超过3层或建筑面积超过300平方米，需按《建筑法》申请建筑工程施工许可证，并由具备资质的施工单位施工。此外，建筑需符合消防、抗震等安全标准，否则可能面临整改或拆除风险。

4. 产权登记与确权
   合法建筑应完成不动产登记，取得宅基地使用权证和房屋所有权证（或不动产权证）。未登记的建筑虽不一定违法，但可能影响权益保障（如拆迁补偿、抵押贷款等）。

特殊情形提示：

• 若建筑建于2008年《城乡规划法》实施前，部分地区可能按“历史遗留问题”处理，需结合地方政策补办手续；
  
• 若涉及“小产权房”（建在集体土地上向非本集体成员出售的房屋），因违反土地管理法规，通常无法合法化。

建议：若您正在规划农村建房，可先向当地乡镇政府或自然资源部门确认宅基地合法性，申请乡村建设规划许可证，并委托专业机构设计施工方案，确保全程合规。如有具体疑问，可直接向我咨询细节。